RNA的m6A修饰研究越来越热，积累的高通量测序数据也越来越多，应运而生的m6A修饰预测数据库给广大科研小伙伴带来了很多便利（小张之前也给大家推荐过许多RNA甲基化数据库，RNA甲基化研究常用的数据库，我收藏了，你呢？）。
目前，引用率比较高的两个m6A修饰预测数据库都发表于2018年，分别是西交利物浦大学生物科学系孟佳教授团队开发的MeT-DBV2.0数据库和中山大学生命科学学院屈良鹄教授团队开发的RMBasev2.0数据库。
2年时间弹指一挥，西交利物浦大学孟佳教授团队又发表了最新的m6A修饰精准预测数据库- m6A-Atlas，提供的高可信度m6A修饰位点超过44万个，且囊括了7种真核生物和10种病毒的数据。该数据库原文标题：m6A-Atlas: a comprehensive knowledgebase for unraveling the N6-methyladenosine (m6A) epitranscriptome，于2020年8月27号见刊生物信息领域的一流期刊Nucleic Acids Research，影响因子11.501。
数据库网址链接：http://www.xjtlu.edu.cn/biologicalsciences/atlas
1) 可信度更高/定量数据：收录了7种单碱基分辨率技术鉴定的442,162个高置信度m6A修饰位点，基于1363个高通量测序样本鉴定出的定量表观遗传修饰图谱。
2) 提供修饰位点保守性分析：收录人、小鼠、黑猩猩等7种脊椎动物m6A修饰位点的保守性信息
3) 纳入病毒m6A修饰图谱数据：收录HIV、KSHV、DENV等10种病毒的m6A修饰图谱情况。
4) 提供功能预测信息：基于表观转录组数据预测各个m6A位点的生物学功能
5) 提供疾病相关性信息：基于可破坏m6A修饰motif的疾病相关基因突变来推断m6A修饰位点的潜在致病机理。
6) 更多转录调控后续机制和其他RNA修饰图谱信息：对m6A修饰位点进行转录后机制注释(RBP结合、microRNA相互作用和剪接位点)，同时也有其他多种RNA修饰的图谱，帮助用户浏览和进一步的研究计划提供理论依据。
Home模块：可直接搜索物种（人，小鼠，大鼠，斑马鱼，果蝇，酵母和拟南芥），基因，基因组区域或者疾病名称，查询相关m6A修饰位点。
Eukaryote模块：真核生物不同RNA修饰，不同技术平台获得的修饰位点总览。
Virus模块：不同样本的病毒m6A修饰位点总览。
2）基于数据库现有数据进行差异修饰m6A区域分析（自己选择物种，对照组样本和处理组样本）
该基因共有54个m6A修饰相关数据，具体列表如下（列表很长，整体展示了m6A修饰所在区域，原始文献ID，GEO数据库上传的数据编号，实验技术类型，研究的样本，是否有RNA蛋白结合，是否有疾病相关证据等）：
54个数据的技术类型占比和样本信息统计图如下（超过30个研究用的都是单碱基分辨率的miCLIP技术，样本类型最多的是HER293T细胞系）：
1） Basic info（修饰位点的基本信息，比如染色体位置，基因位置等）
2） Methylation level （甲基化修饰水平，这里是把54个项目的所有样本数据都整合在了一起，我们可以在下拉框中选择样本类型和处理条件）
3） Gene Expression Level （对于基因的表达水平，同样可以在下拉框中选择样本类型和处理条件）
4）Conservation （该修饰位点脊柱动物中的保守性情况）
5）Landscape（该位点与附近的转录后调控和其他RNA修饰概况）
6）Annotation（该位点的注释情况，如RNA结合蛋白的结合情况，染色质可接近性结果等）
好啦，最新的m6A-Atlas 数据库今天就给大家介绍这么多。想要不做实验就心里有数，赶紧用它！
