一、寻找某个突变基因的靶药或临床意义
以基因突变“BRAF V600E“为例，检索结果如下：（图一），红色，绿色，紫色和黄色框框分别代表了基因信息，变异位点列表和分组信息，变异位点信息以及临床意义证据。
图一
我们重点看临床意义证据这块：
（1）EID，DIS，DRUGS，DESC分别是证据ID，癌种，药物和证据描述。提示了针对这个基因变异，哪些癌种中有对应的靶药。
（2）如果要确认，对靶药是敏感的还是耐药的话，可以看后面的证据详情：“EL”,“ET”，“ED”,“CS”,“VO”，“ER”（分别表示“Evidence Level”,“Evidence Type”,“Evidence Direction”，“Clinical Significance”，“Variant Origin”，“Evidence Rating”）。
下面是关键字的解释（可参考图二和图三）：
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关键字 |
解释 |
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证据等级（EL） |
指示用药证据强弱，由A至E依次较低 |
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证据类型（ET） |
指示该位点具有诊断，用药还是预后意义 |
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证据方向（ED） |
指示证据是支持性的还是否定性的 |
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临床意义（CS） |
指示该变异的临床意义（比如对该药物是敏感的还是耐药的） |
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变异来源（VO）和证据星级 (ER) |
分别指示变异是胚系或者体系，文献证据强弱 |
比如图一中证据 ID 为1409的条目说明：在皮肤黑色素瘤里面如果发生了 BRAF V600E，该患者可能对维莫非尼（Vemurafenib）敏感，而且有很强的支持证据（等级A）。
图二
图三
二、无需注册及登录，可直接鼠标点击下载
CIViC 虽然是免费数据库，但是同时具有超高更新频率，相比 JAX-CKB 的部分免费，OncoKB由免费下载变为需要 license ，My Cancer Genome 只能免费在线观看或者其它多年不更新的数据库而言，真实良心，点点鼠标即可下载。
图四
网站提供了TSV和VCF两种格式。VCF方便生信处理和注释，个人还是更喜欢TSV格式文件，因为里面信息更为丰富。各个文件均带有基因编号，变异位点编号和证据编号，准备妥当的关系数据库结构是做自动化伙伴的福音，实在是够贴心。
当依次点击下载图四中 01-Nov-2020 版本的 “Genes”,“Variants”,“Evidence”,“Variant Groups”, “Assertions”对应的TSV之后：
即可获得：
（1）“01-Nov-2020-GeneSummaries.tsv”：肿瘤相关的基因列表和基因介绍。
（2）“01-Nov-2020-VariantSummaries.tsv”：变异位点列表和变异位点介绍。
（3）“01-Nov-2020-ClinicalEvidenceSummaries. tsv”：里面包含了变异位点对应的靶药，以及证据等级。
（4） “01-Nov-2020-VariantGroupSummaries. tsv”和“01-Nov-2020-AssertionSummaries. tsv”分别是 CIViC 将变异归类和用其它相关指南标准进行分级的信息。
