【科研吐槽】避免学术不端 细胞系的交叉污染问题不能忽视

来源:我自己拍的

细胞实验是我们医学研究必不可少的部分,也是研究作用机制的重要途径。在我们的科研途中,细胞实验可谓是最日常的实验。然而,通常情况下,刚入实验室的科研小白自然是用课题组长期使用的或是在保存状态的细胞株。有些细胞可能已经有近10年的历史或是更久,你的师兄师姐可能也是直接拿来就用。但是随着科学技术的进步,有些细胞被鉴定出它已不是我们长久以来认知的细胞,而其实是别的细胞,可能你们都不知情。

据统计,约18%-30%的细胞系被交叉污染或错误辨识,使用这些细胞可能导致研究结果错误、结果不可重复的严重后果中科院昆明细胞库在2017年和2016年分别公布了一些错误鉴定或交叉污染的细胞,可见被污染的细胞数量之多和种类之广。

来自:中科院昆明细胞库官网

在期刊的作者指南处,许多期刊明确要求作者提供细胞系的鉴定证明。一般我们提供细胞的STR鉴定证书即可。因为你以为的并不一定是你以为的,杂志社要他们以为。

来自:Elsevier出版社旗下Cancer letters的投稿指南

近几年的细胞库在寄送细胞时,一般都会附带STR证书一起寄过来。但之前的肯定都没有。科研界目前普遍建议最好在实验开始时就对所使用的细胞进行身份的鉴定,并且每隔一段时间重新购买细胞更新一下冻存的种子。

去年我们课题组曾遇到过一次尴尬的经历,投稿后杂志社返回的意见是,我们所使用的细胞实际为hela细胞污染的,所以拒稿。我们千辛万苦的培养好细胞做好实验,投稿后被指出所使用的细胞并不是我们一直以为的细胞。。。。。。我们全员震惊!内心仿佛被一万只草泥马踩踏过。

因此我们赶紧检查课题组所保存的几株细胞系,发现有好几株实际上都是被污染的,赶紧扔掉。我仔细问了一些权威公司,实际上这些细胞可能从一开始建立细胞系时就是被HeLa细胞污染的,但是当时的科学技术并没有鉴定出来。所以直到现在,随着技术的进步证实了有些细胞其实是被别的细胞污染的。所以大家在使用实验室保存很久的细胞时,不妨查一查,这株细胞有没有问题,还能不能使用,防止出现浪费时间精力的做法。

给大家分享一个查验细胞的网站(网站连接附上:https://web.expasy.org/cellosaurus/。Cellosaurus是一个发布有关细胞系的知识资源和信息的网站。只要在搜索栏输入你要查的细胞即可看到有关这株细胞的种属(人or鼠or兔or其他)、疾病类型即细胞的获取来源(例如胃腺癌or胃淋巴结转移瘤or等)、倍增时间、基因祖先(亚洲or非洲or欧洲等)、细胞系的性别等等信息。

来源:Cellosaurus官网

举个一直以来被错用的细胞的例子。胃癌细胞系一直常用的有BGC-823、MGC-803,此外还有一些小众细胞系SGC-7901等,其实都不是胃癌细胞,而是被Hela污染的细胞。所以你用那些污染的细胞做研究,发文章表明一些新见解新有效方法其实是矛盾的。

来源:Cellosaurus官网

我们对于那篇因细胞系被拒的文章在后续的投稿中发现,有些杂志社还未发现这个问题,并没有提出对细胞的质疑。但是读这篇文章的你绝不能存侥幸心理,万一突然那一天学术界都统一口径对一些细胞存在质疑,那你的实验全部付诸东流。所以现在立刻马上去检索一下你的细胞吧,至少对它多些了解不是坏处。

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