
- solexa测序技术(即大家耳熟能详的illumina测序平台);
- 454测序技术(读长长,但是准确度较低,成本较高,即焦磷酸测序技术,少量市场占有);
- solid测序技术(双色编码技术,目前基本在市场上见不到了)。





图2 RNA-seq分析标准流程(引用自诺禾致源)


- MeDIP-Seq技术(methylation DNA immunoprecipitationsequencing,甲基化DNA免疫共沉淀),是研究甲基化的一种有效的手段。由于在哺乳动物中甲基化一般发生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上,所以可通过特异性结合甲基化DNA的蛋白MBD2b或5’-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA片段,并结合第二代高通量测序,对富集到的DNA片段进行测序,从而检测全基因组范围内的甲基化位点。
- ChIP-seq,染色质免疫共沉淀技术,研究体内蛋白与DNA相互作用的一种方法先通过ChIP 特异性地富集与目的蛋白相结合的DNA片段, 而后对所得DNA片段进行高通量测序。