结论一：胰腺导管腺癌单细胞图谱特征
研究结果第一部分是导管腺癌（PDAC）的细胞图谱特征。作者首先展示了经典的单细胞tSNE降维聚类图，即PDAC中的细胞类型以及细胞占比（Figure 1b）。随后作者使用热图和小提琴图展示每种细胞类型的marker基因的表达（Figure 1c,d）。接下来作者的关注重点主要是1型导管细胞（Type1 ductal cells）和2型导管细胞（Type2 ductal cells）。
Figure 1
结论二：单细胞CNV水平鉴定PDAC中的恶性导管细胞
为了鉴定恶性细胞，作者比较了实验组和对照组之间以及不同细胞类型之间细胞CNV水平的差异（Figure 2a）。作者发现，实验组导管腺癌细胞的CNV水平显著性高于对照组，并且在实验组中，2型导管细胞的CNV水平显著性高于1型导管细胞和其他细胞。作者接下来比较了PDAC中两种导管细胞的基因表达特征，发现2型导管细胞高表达肿瘤功能相关基因，1型导管细胞高表达正常胰腺功能相关基因（Figure 2c,d）。以上结果说明，相对于1型导管来说，2型导管是恶化程度较高的导管细胞。此外，作者对两种导管细胞的marker进行免疫组化，发现通过单细胞测序鉴定出的marker基因可以作为临床中导管腺癌进程的分子标志物（Figure 2e,f）。
Figure 2
导管腺癌中存在趋于正常胰腺功能的1型导管，也有恶性化程度较高的2型导管，作者通过拟时序分析绘制了导管细胞的恶性化进程轨迹（Figure 3a）和基因表达特征（Figure 3b-d）。结果发现，伴随着导管的恶性化进程，导管高表达细胞增殖和细胞迁移相关的基因。
结论四：基于恶性导管细胞的marker基因进行TCGA数据挖掘
基于上述挖掘到的恶性导管细胞的marker基因，作者进行TCGA数据挖掘。根据基因表达特征的不同，将178个PAAD病人分为4种类型，其中cluster2（Figure 4a红色）和cluster3（Figure 4a绿色）高表达细胞增殖相关的基因，并且有着较差的预后（Figure 4d），表明增殖性导管伴随着较差的预后。另一方面，作者通过IPA分析初步筛选了3个候选基因（Figure 4e），通过不同的靶点抑制剂作用实验发现CDK1可以作为一个比较好的潜在治疗靶点（Figure 4f）。
Figure 4
结论五：增殖性导管细胞伴随着T细胞活化的缺失预示着较差的预后
前面作者发现增殖性导管细胞伴随着较差的预后，这里作者对TCGA数据进一步挖掘发现增值相关基因和T细胞活化基因表达呈负相关（Figure 5d），并且通过免疫组化验证了这一结果（Figure 5f）。以上结果表明，增殖性导管细胞伴随着T细胞活化的缺失预示着较差的预后。
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原文：Single-cell RNA-seq Highlights Intra-Tumoral Heterogeneity and Malignant Progression in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma.
杂志：Cell Research，IF=17.848
Pubmed：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31273297/?from_term=single-cell+rna-seq+highlight+intra-tumoral&from_pos=1
DOI：10.1038/s41422-019-0195-y.
