生信入门篇R语言书籍推荐

我们为大家整理了12本学习R语言的好书,相信这几本R语言书籍能助你快速走进通往奥秘的大门。

01

 

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本书重点讲解R的绘图系统,指导读者通过绘图系统实现数据可视化。

书中提供了快速绘制高质量图形的150多种技巧,每个技巧用来解决一个特定的

绘图需求。读者可以通过目录快速定位到自己遇到的问题,查阅相应的解决方案。

 

同时,作者在大部分的技巧之后会进行一些讨论和延伸,介绍一些总结出的绘图

技巧。

 

作者的理念是用合适的工具来完成合适的绘图任务,读者也可以学到许多其他有用的绘图函数

和工具,来适应各种复杂的需求。

 

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本书是R语言领域公认的经典著作,由著名计算机科学家兼统计学家撰写 Amazon五星级畅销书。它是一本面向R语言开发者的纯编程类书籍,不需要读者具备统计学基础,从编程角度而非统计学角度系统讲解了R语言的数据结构、编程结构、语法、 TCPIP网络编程、并行计算、代码调试、程序性能优

化、编程技巧以及R语言与其他语言的接口等所有与R编程相关的知识,几乎面面俱到。

本书的实用性也非常强,44个精选的扩展案例,充分展示了R语言在数据处理和统计分析方面的强大能力。

04

本书介绍的 ggplot22是R中新颖的数据可视化包,功能强大、灵活便捷,其灵感

源自 Leland Wilkison的《图形的语法》一书。

05

本书从最简单的R语言绘图开始,全面介绍了R语言的两大绘图系统:传统绘图系统和grid绘图系统,以及基于rid绘图系统的两个主流扩展包: lattice和 ggplot22。

再从应用出发,讲解了基于grid绘图系统的绘图函数与绘图类的开发。

后深入探讨了R绘图系统底层的工作原理。此外,本书还介绍了绘制特定领域图形(如地图、动态图和3D图等)相关的R扩展包。

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本书既是一本R语言的书,又是一本生物信息学的书,因此考虑到大量读者可能来自生物信息学或相关领域,本书作者写下如下寄语,以求共勉。在人类基因组催发的第一轮生物信息热潮衰退后,生物信息一度陷入一个很大的低潮,在很多科学“大牛”断言生物信息学科是一个“Junk”后,很多激动人心的事件接连发生了…

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R是一款优秀的开源统计应用语言,它直观、易用、低成本,而且还有庞大的社区支持,随着数据挖掘技术的兴起,R语言得到了广泛的应用。

本书介绍从安装R软件到基本语法以及应用的全过程,可以帮助你全面地学习和使用R。

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本书是国内第一本系统介绍R语言 Biocond及软件包的图书。

 

语言是一种计算机程序设计语言,也是一个开放式的软件开发平台R语言具有强大的数学统计分析和科学数据可视化功能,能提供各种数据处理、统计分析及图形显示工具。软件研究人员可以在R语言这个开放平台上不断扩充其功能,开发出面向特定应用的软件。

Bioconductor就是一个基于R语言的、面向基因组信息分析的应用软件集合。 Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前,它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具,其中大多数工具是针对DNA微阵列或基因芯片数据的处理、分析、注释及可视化的。同时, Bioconductor还提供许多与DNA微阵列相关的数据包。

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本书通过三个精心挑选的例子,深入浅出地讲解如何使用R语言玩转数据。书中涵盖R语言编程的方方面面,内容涉及R对象的类型、R的记号体系和环境系统、自定义函数、 else语句、for循环、S3类、R的包系统以及调试工具等。

本书还通过示例演示如何进行向量化编程,从而对代码进行提速并最大化地发挥R的潜能。

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本书是R语言的一本入门教材,讲授学习R必备的内容仅使用最基本的统计知识,介绍R函数的使用方法,以及如何使用R的内置函数去解决统计中的问题.介绍R中与数值分析相关的内容,并利用相应算法来学习R语言的编程.介绍R的绘图功能,及相关的绘图函数.

本书的每一章是针对一类问题设计的,讨论的内容由浅入深、循序渐进并在最后一章介绍扩展R的方法,读者可以根据自己的需求扩展R的相关功能。

 

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本书注重实用性,是一本全面而细致的R指南,高度概括了该软件和它的强大功能,展示了实用的统计示例,且对于难以用传统方法处理的凌乱、不完整和非正态的数据给出了优雅的处理方法。

作者不仅仅探讨统计分析,还阐述了大量探索和展示数据的图形功能。

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本书囊括了从各种不同格式的数据文件读取数据的技术以及采用适当的R内部数据格式保存数据的技术,对于诸如日期和时间型数据的处理、下标工具的应用、字符型数据的处理以及数据框的应用技术都通过丰富的实际或模拟数据实例作了精彩讲解。

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