大家好！今天要和大家共同分析的文献为2020年5月发表在Frontiers in Oncology（IF = 4.137）上的文章。本文全面分析了m6A调节基因mRNA表达与结直肠癌的发病、发展及预后之间的关联。通过使用Cox回归分析、LASSO算法、生存曲线分析及列线图分析，发现WTAP和FTO的异常表达与结直肠癌的病程发展显著相关，并且YTHDC2和ALKBH5是可以独立预测结直肠癌患者预后的关键基因。这项研究表明了RNA修饰在结直肠癌病程发展中的重要作用，并为治疗方法的选择提供了潜在的指导性生物标记。
题目：Exploration of Potential Roles of m6A Regulators in Colorectal Cancer Prognosis
探索m6A调节基因在结直肠癌预后中的潜在作用
摘要
结直肠癌（CRC）是世界范围内发病率最高的常见恶性肿瘤之一。自从首次发现以来，RNA甲基化（m6A）就被认为对癌症的发生和发展有巨大影响。本文全面分析了m6A调节基因的mRNA表达与来自TCGA数据库中CRC肿瘤样本的流行病学信息之间的关联。应用多变量Cox回归模型筛选m6A调节基因，这些调节基因的mRNA表达与CRC肿瘤样本的总体生存率有显著相关性，并将这些显著变化调节基因用于LASSO回归分析以构建CRC预后预测模型。在多变量分析中选择了两个m6A调节基因，即YTHDC2和ALKBH5。基于这两个调节基因构建CRC预后预测模型，通过该两个调控基因的表达情况可以明确区分预后良好和较差的CRC肿瘤样本，而与潜在的混杂因素无关。这项研究应有助于识别不同预后的CRC患者和指导治疗方法的选择。
流程图
文章概述
1. 数据的选取
本文选取了TCGA数据库中的522个样本，其中包括487个结肠直肠癌组织，以及35个癌症周边组织样本，详细情况见表1。
表1
2. m6A与CRC发病及发展的相关性分析
图1
3. m6A与CRC预后的相关性分析
图2
4. CRC预后预测模型构建
图3
5. 风险评分与流行病学数据相关分析
图4
6. 列线图构建及验证
图5
结语
本文通过TCGA公共数据库的结直肠癌数据，结合了RNA编辑与结直肠癌的可能性联系，系统性分析了RNA编辑相关基因与结直肠癌发病、发展及预后之间的关联。筛选出了2个与CRC病程发展相关的基因，找到了2个基因可以预测CRC预后。与前期分享的一篇文章分析思路及方法大体相同，这是一套针对公共数据的适用性很强的分析流程。
本文的亮点是将m6A基因与不同病程分型的结直肠癌联系在一起分析，并得到了较好的预测模型。除此之外，本文也有两个需要提高的地方，一是分析的方面很多，结直肠癌的发病、发展及预后都有分析，得到了不同的变化基因，但没有联系起来，显得结果有些散乱；二是缺少外部数据的验证，结果的广泛适用性存疑。
