2019年12月，由新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引起的肺炎疫情在武汉市出现，很快世界各地陆续爆发新冠疫情。截至目前（5月21日），据约翰·霍普金斯大学发布的实时统计数据，全球累计新冠肺炎确诊病例超过500万例，死亡人超过32万。目前对于新冠肺炎仍没有特效药何疫苗问世，这种大流行还将持续。对公共卫生的关注以及对有效治疗措施的迫切需要，需要对新冠肺炎的流行病学，传染性和发病机理进行深入研究。2020年5月20日，上海公共卫生临床中心卢洪洲教授、上海交通大学医学院附属瑞金医院陈赛娟院士、Wang Shengyue等人在 Nature 在线发表题为：Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19 的研究论文。该研究通过分析上海的326例确诊新冠肺炎病例的临床、分子和免疫学数据，对比新冠病毒基因组数据，表明新冠病毒在疫情爆发初期至今显示出稳定的进化过程，但这些病毒的进化并未显著影响患者的临床结果，对新冠肺炎患者病情程度影响最大的还是自身因素，如年龄、淋巴细胞减少、细胞因子风暴等。研究团队分析了来自上海的326例确诊新冠肺炎病例的临床、分子和免疫学数据。由112个高质量样本组成的SARS-CoV-2基因组序列与全球共享所有流感数据倡议（GISAID）中的序列显示出稳定的进化过程，并暗示了在武汉疫情暴发初期，有两个具有不同暴露史的新冠病毒主要谱系 。然而，它们表现出相似的毒力和临床结果。淋巴细胞减少症，尤其是入院后CD4+和CD8+ T细胞数量减少，可预测疾病进展。在治疗期间，观察到重症患者和危重患者的IL-6和IL-8具有非常高的水平，并与淋巴细胞数量降低相关。疾病严重程度的决定因素似乎主要来自宿主因素，例如年龄，淋巴细胞减少症及其相关的细胞因子风暴，而病毒的遗传变异并未显著影响患者临床结果。
