“工欲善其事必先利其器”,一款优秀的软件工具可以极大的提供工作效率,让人赏心悦目,心旷神怡。而vscode就是一款非常优秀的工具,建议每一台电脑中都应该安装一下。
vscode是干啥的?
在做生物信息分析过程中,经常需要查看序列,编辑文本,修改程序代码等,这个过程中就需要使用文本编辑器。一般系统自带的文本编辑器都过于简单,例如windows的记事本等,不能打开大文件,不能识别不同换行符,不支持语法高亮等,无法达到工作要求。优秀的文本编辑器有很多,例如收费的Utraledit,Sublime Text3,editplus等,免费的有notepad++,atom等,这里我们推荐使用微软推出的vscode编辑器,它的一个显著特性就是支持windows,mac和Linux多个平台,使用体验都差不多。安装完在图形界面下,可以使用右键快速打开多种扩展名的文本文件。
下载地址:https://code.visualstudio.com/
软件安装
软件的安装和使用比较简单,直接下载对应的系统版本即可。然后下一步下一步安装就行。这里需要特别注意,在安装第二步,最好将下面两项勾选上,这样做的目的是在鼠标右键会多处一个“通过code打开”的菜单,这样打开文件非常方便。
软件使用
接下来在系统中,常用的文本文件都可以直接使用vscode打开了。比如windows系统中各种扩展名的文件,比如*txt,.log等,不需要都使用excel,word,记事本打开了。包括各种生物数据,fastq,fasta,gff,vcf,bed等格式,最好都使用vscode来打开,而不是记事本或word。
安装中文语言包
默认的使用语言是英文,如果不习惯看英文菜单,可以通过安装扩展包设置为中文菜单,也很简单。选择安装扩展包,左侧最下面的选项图标,然后搜索“Chinese”,点击安装,然后重启就可以了。
配置python
如果你只把vscode当成一个文本查看的工具,也没问题,不过那样就太大材小用了,vscode的核心功能是用来写程序的(没错,要不然为什么要叫做Visual Studio Code呢),你可以将其配置成多种编程语言的编辑器,比如常见的python与R,具体如何配置,可以先自信摸索,后面有时间在一一诉说。