用R来做临床研究亚组分析的森林图教程 meta分析 20年4月14日 转载大师 取消关注 关注 私信 前面我给大家分享过一些R语言的资料,在编程语言里R语言最强大的功能是做图功能,我们知道在做Meta分析的时候会需要做森林图,实际上我们在很多临床研究中也经常看到森林图,主要是亚组分析的森林图,比如下面这篇文章里的一个森林图: 今天就教教大家怎么用R语言来做上面这种亚组分析的森林图 1. 在Excel里编辑好数据,按照下面的格式整理,保存为csv格式 2. 下载安装R跟Rstudio R软件的下载地址: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ Rstudio下载地址: https://rstudio.com/products/rstudio/download/ RStudio是一款R语言的IDE,R自身软件用起来可能不是很方便,而Rstudio很好地解决了这个问题,而且它还具有调试、可视化等功能,支持纯R脚本、Rmarkdown (脚本文档混排)、Bookdown (脚本文档混排成书)、Shiny (交互式网络应用)等。 安装顺序:①R ②RStudio R是RStudio的基础,必须先安装R,再安装RStudio。即使只使用RStudio,还是需要事先为计算机安装好R。RStudio只是辅助你使用R进行编辑的工具,因为它自身并不附带R程序。 3. 下载安装forestplot包 (1)打开Rtudio,首先要设置包的安装来源,在Tools中点击Global Options,在弹出来的对话框中修改Packages的来源,找一个中国(China)的地址,下载速度比较快。 (2)安装forestplot包 在Rstudio中右下角选择Packages,点击Install,在弹出来的对话框中输入forestplot,然后点击install 安装完成后在左下角代码运行环境会有提示: 4. 加载forestplot,在左上角输入代码: library(foresplot) 然后Ctrl+回车执行代码 5. 导入Excel数据 可以通过下面的代码导入外部数据,我们的Excel文件保存的是csv格式,注意文件要放在你的R工作路径下。 用setwd函数可以设置工作路径,比如你的数据放在D盘study文件夹,那么输入setwd(“D:/study”),并执行。 然后输入下面代码 forest <- read.csv(‘forest.csv’,header = FALSE) 也可以通过Rstudio右上角Import Dataset导入外部数据 注意用菜单导入的时候要把Excel文件另存为xlsx格式,同时去掉第一行为变量名的勾,另外第一行的变量名跟上面代码导入的也有差别。 6. 然后输入下面红框里的代码,绿色内容为每行代码的解释,有疑问的可以留言讨论 7.森林图绘制完成,点击右下角的Export,选择导出为PDF格式,然后下拉菜单选择自定义大小,修改下大小为15×15,可以修改保存位置和文件名。 8.打开PDF,看看我们做出来的森林图,还是不错的吧。 9.因为导出的是矢量图,你可以进一步用AI(Adobe Illustrator)软件对森林图进行修改,所有内容都可以美化修改! 总结一下,R软件绘图功能是很强大的,对于新手来说学习代码确实有点枯燥,但只要你肯用心一定能学会,R绘图功能目前已经广泛应用在各个领域,对这个比较感兴趣的可以试试。 推荐阅读: 使用R语言进行单量率的meta分析(附代码) 利用R语言使用相关系数法进行meta分析 R语言完成常用的Meta分析代码及教程 用R语言复刻Meta分析文献 网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版) Meta分析R语言
分享的不对能不能别乱发,浪费彼此时间
输入完用哪个显示森林图
请问老师这个p value是怎么计算的
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