知道40%的lncRNA、circRNA有潜在的编码多肽（peptide）的能力吗？
前面咱们也讲到过一些lncRNA、circRNA，文章的质量高至CNS级别，大都和某些疾病息息相关，尤其非编码RNA的翻译话题越来越热，文章也多了起来，慢慢地成为了又一大研究热点，心动了没？
a.人体组织中特异性circRNA的分布；
b.circRNA翻译元件的分布；
c.细胞特异性的circRNA很丰富
在RNA-seq的结果中，习惯上我们将编码蛋白太短不足100个AA的RNA视为非编码RNA（ncRNA），但这一界定显然“错判”了很多RNA，比窦娥冤。
那如果我们要做lncRNA、circRNA的多肽研究的时候，如何下手呢？
（1）预测ncRNA是否存在sORF
咦，什么是sORF？就是small open reading frames (sORFs)，就是短开放阅读框，即编码蛋白质的序列，以ATG开始–终止密码子结束。
（2）核糖体RNA测序技术（Ribosome Profiling）
判断一个lncRNA、circRNA是否编码多肽（peptide），最直接的方式就是定位其是否与核糖体相互结合，使用核酸酶消化RNA时，在翻译进行时的核糖体保护了大约30bp的RNA片段，将细胞中这些被保护的RNA片段构建成cDNA文库，再使用RNA-seq技术对文库中所有的片段进行测序，这样的数据库就可以查看ncRNA是否编码多肽了。
核糖体RNA测序可定量探测翻译中的RNA数量
（3）预测lncRNA、circRNA编码的网站
CPC？最近上不去，咱们介绍两个新的
①lncRNAtor：lncRNA编码预测
http://lncrnator.ewha.ac.kr/
②circRNADb：circRNA的编码能力预测
http://reprod.njmu.edu.cn/circrnadb/
登录网站，用circRNA的“NCBI转录本”号进行搜索，然后点击查看
会看到circRNA的DNA序列，以及编码的蛋白序列，然后去NCBI的蛋白BLAST一下，看看是什么功能的蛋白或者多肽。
发现其表达的蛋白是泛素特异性蛋白酶，提示了其多肽功能。
如果lncRNA和circRNA可以编码这么多多肽，那么这些多肽到底起着什么作用呢？等待咱们去进一步挖掘吧。
