火山图（Volcano Plot）是大家在文章里面经常看到的图，特别是在展示差异表达的基因时，常常出现在芯片、测序等组学检测技术的结果中，与热图等等常一起出现：
下面我们就说明下如何看懂和绘制火山图。
下面是一个比较标准的火山图：
下面我们看一下火山图的绘制。
使用工具：Graphpad Prism，数据：Volcano Plot.xls
这里我们用的是Graphpad 6.0版本，把Excel中的数据复制进来：
然后进行绘图，选择散点图：
这是草图：
接下来我们开始设置：
1. 双击Y轴，在打开界面Format Axes//Frame and Origin中，把Set origin设置为Lower left：
结果：
2. 下面我们添加X=-1，X=1和Y=1.30103的虚线。
还是在刚才的界面中，X axis中：
Left Y axis中：
双击虚线，设置格式：
设置后的新图：
3. 设置点的大小和颜色：
双击任意点，在打开的对话框中选择点的大小：
分别右键单击某个点：
这里我们可以设置这个点的颜色、形状、大小，这个点的基因名通过Show Row Title来设置，通过这样的方法可以把显著表达高于两倍的设置为红色，把显著低于2倍的设置为绿色，也可以把我们感兴趣的基因另外标记为上三角和下三角：
4. 调整格式，导出图片：
