pheatmap

  • 利用pheatmap包画一张漂亮的热图

    今天给大家介绍一款比较好用的画聚类图的R包–pheatmap,全称pretty heatmaps,漂亮的热图,所以取“漂亮的热图”这个标题不是小编膨胀了,人就叫这名儿。 安装方式 install.packages(pheatmap) 关于作图的数据,我们以小张聊科研数据挖掘课程最后的案例为例,本案例有三个GEO数据集,GSE19665, GSE3…

    2019年11月15日 0 945
  • 画图专题:热图pheatmap()函数

    先看一眼这个函数的参数,这么多! 而且最后还有省略号! 那么我们应该怎么合理使用这些参数让你的热图看起来更加高大上呢? 数据准备: 此次例子,我们选择了一套GEO数据库的肺癌数据,数据编号为GSE19804,120个样本,其中包含60个癌症样本和60个癌旁正常样本,前面我们使用t检验,并对p值进行BH校正,筛选fdr小于0.01的基因中前40个在癌症相对于正…

    2019年11月1日 0 591