mRNA

  • mRNA代谢动态全解析

    在现代分子生物学中,具有高维度、动态化特征的基因表达谱被广泛认为是连接生物体遗传特征、外界环境刺激与表现型之间的最重要的桥梁,也是标定细胞状态的最终指征。而RNA高通量测序技术和蛋白组质谱技术的成熟也使得研究人员在各类自然或人为的生物学环境中对基因表达进行精准测量成为了日常。不过,基因表达这一概念背后暗含的多层级、多角度的复杂调控机制所带来的不确定性却往往受…

    2020年1月8日 0 231
  • 剪切变异:一个被“遗忘”的研究热点

    什么是可变剪切? 可变剪切(Alternative Splicing,AS)是指一个mRNA前体通过不同的剪切方式(选择不同的剪切位点组合)产生不同的mRNA剪切异构体的过程。可变剪切是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。 国内基金申请情况 可变剪切相关的基金项目往往多与其他热点结合,历年总的资助金额不到1亿。就2019年而言,可变剪切相关的基金数的…

    2019年12月28日 0 653
  • 文献解读:加权基因共表达网络分析喉癌中的lncRNA和mRNA表达谱

    今天跟大家分享的是十一月份发表在Aging杂志上的一篇文章,这是一篇关于利用WGCNA分析喉癌中lncRNA和mRNA的研究。 Characterization of long non-coding RNA and messenger RNA profiles in laryngeal cancer by weighted gene co-expressio…

    2019年12月27日 0 623
  • 文献解读:mRNA-miRNA-lncRNA网络在胰腺癌中的作用

    摘要 近年来,越来越多的证据揭示了mRNA-miRNA-lncRNA网络在多种人类肿瘤中的作用。然而,与胰腺癌预后相关的系统的mRNA-miRNA-lncRNA网络仍然缺乏。 研究结果   图1 图1:胰腺癌中显著差异表达基因(DEG)的鉴定。 (A)显示从GSE16515确定的DEGS的火山图。 (B)显示从GSE15471中识别出的DEGS的火…

    2019年12月26日 0 442
  • 用NCBI查找已公布的(mRNA、lncRNA)引物序列

    1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意:用此方法只建议进行 mRNA和lncRNA的基因表达引物查找。 一、mRNA引物序列查找 步骤都在图上,这里就不做多的说明啦~ 二、LncRNA引物序列查找

    2019年12月12日 0 696
  • 文献解读:泛癌+亚型+多组学=高分生信文章

    单组学、单癌种的纯生信分析如今越来越难发高分杂志了,越来越多杂志青睐于泛癌或多组学的生信分析。小编今天给大家分享一篇泛癌+亚型纯生信高分的文章,希望对你有所收获。 DOI: 10.1016 / j.celrep.2018.03.075 IF:7.815 简介:作者利用了TCGA泛癌中pan-kidney的数据比较了肾细胞癌不同组织学亚型各组学之间的差异,刻画…

    2019年11月15日 0 816
  • 利用BBCancer挖掘血液中的新肿瘤标志物(Biomarker)

    在医院抽血检查辅助诊断疾病时,每个指标都有自己的意义。也有很多指标是用来辅助筛查肿瘤的,像CEA、CA199等等这些都是非常经典的肿瘤标志物。   但随着技术的进步,大家都希望能够找出一些更好的biomarker帮助医生更早也更方便地发现肿瘤的来。基于血液的检查,也就是液体活检应该是最方便的检查方式了。对于想要做研究的人来说,一直缺乏一个好的数据库或者工具帮…

    2019年11月8日 0 623
  • RNA-FISH实验流程

    在近十年的生物科研界,RNA可是个引领潮流的“弄潮儿”,mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA,吸引着无数科研狗们前仆后继,可谓是火的一塌糊涂。打开pubmed,随便搜几篇RNA的文章,几乎每篇都有RNA荧光原位杂交(RNA-FISH)的身影,然而受限于实验仪器,技术或者经费的影响,对于一些童鞋来说,RNA-FISH始终如那海市蜃楼一样,可望而不…

    2019年11月3日 0 584
  • Western blot实验中内参基因的选择方法

    实验内参,即是在检测细胞内分子表达变化时选择的参照物,其在细胞内的表达相对恒定,在处理因素作用条件下不会发生表达改变的基因。内参同样可以校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。   1、管家基因 最普通的内参是内源性参照基因,也就是管家基因(持家基因,house keeping gene)。 管家基因是一类始终保持着低水平的甲基…

    2019年11月3日 0 537
  • mRNA的胞内研究技术路线(研究思路)

    眼看2019年就快过完了,老板交给你的标书完成了吗?实验方案搞定了吗?   RNA也分为很多种了,像miRNA、mRNA、lncRNA、circRNA等,前面也有蛮多的文章介绍过了,咱们今天主要介绍mRNA的研究路线。 mRNA的研究也分细胞外和细胞内,细胞外的研究技术很多,咱们今天了解一下mRNA的细胞内研究技术和策略:转录、成熟、出核、翻译、降解。 mR…

    2019年11月2日 0 694