ImageJ

  • Transwell的ImageJ五步分析法与经验总结

    Hello,大家好,我是贫穷激发创造力的科研鳖,最近做了一批TRANSWELL,从预实验到染出还能看的东西着实费了一番心思,但是最后分析数据的时候常用的平台都没有什么好贴。万幸小鳖我斥巨资购买的VPN让我从油管里看到了希望,加上自己的改进,觉得还挺靠谱,分享给亲们~ 一、首先安装ImageJ+ file-open windows用户直接安,IOS的老铁们先安…

    2020年5月27日 0 357
  • ImageJ高效图片分析技巧

    俗话说:时间就是金钱,效率就是生命。高效分析图片对科研人员来说不仅意味着能早日发表SCI论文还能节省头发。   举个简单的例子,Masson三色染色是胶原纤维染色的权威经典方法,染色结果肌纤维呈红色,胶原纤维呈绿色或蓝色。   如何高效的分离Masson染色的红色和蓝色并计算其胶原容积分数呢?ImageJ就你能轻松实现不同颜色的分离:   接下来今天半夏给大…

    2020年5月18日 0 494
  • Western Blot条带分析之ImageJ

    Image J是NIH开发的免费软件,它强大之处在于可以计数一张图片的细节。 比如,下面这张图片,你能跟我说它有多少细胞? 或者,这个条带,你说说它们之间究竟相差多少? 相差很多。。很多是多少? 下面我们用Image J分析一下 打开软件——File——open(选择你要分析的图像) Image——Type——8bit(说是一般8就够了) Analyze——…

    2020年3月8日 0 274
  • 如何用ImageJ分析Western Blot条带

    上次说到Western条带的统计,有同学提到了其他的统计方法,回来翻了翻自己的软件竟然还真有其他的,只是自己逐渐养成的习惯,把其他的丢掉了,那就索性也来一起探讨一下,这期先探讨imageJ,下期探讨一下image lab,早就想着把ECL发光后条带也拿来探讨一下,但是自己总是给自己找理由,说找条带需要时间,那我就逼一下自己,下下期ECL条带分析,不见不散。这…

    2020年3月8日 0 420
  • ImageJ划痕实验宽度分析教程

    伤口愈合实验(Wound healing assay)是一种操作简单、经济实惠的研究细胞迁移/肿瘤侵袭的体外试验方法,在SCI论文中得到了广泛的使用【1】。   如何分析划痕实验结果却令很多人头疼! 划痕实验常见的统计指标是统计伤口愈合百分比(Wound healing percentage)和划痕宽度。 伤口愈合百分比本质上是一种面积分析,半夏在往期已经给…

    2020年2月28日 0 931
  • 利用ImageJ测量物体的面积大小教程

    介绍 ImageJ是一个非常强大的科研中常用的工具,那么在实验中,我遇到了如下情况,我拍到了伤口以及尺子的图片,那么我如何知道伤口的面积大小呢?下来,小编教你用ImageJ轻松解决。 参考文献:Shi M, Zhang H, Song T, et al. Sustainable dual release of antibiotic and growth fa…

    2020年2月22日 0 797
  • 利用ImageJ对图片进行背景校正(白平衡、平场校正)

    在利用明场或荧光显微镜成像时,往往会由于样品厚度不一、镜头污渍或者光照不均等因素,降低图片质量,从而影响分析以及展示。 这篇文章就为大家介绍:怎样利用 ImageJ 对图片进行背景校正,包括两个方面:白平衡以及平场校正。 一、白平衡 白平衡(White Balance),在数码摄影中常常会遇到,在拍摄显微镜的明场图片时,更是值得关注的一点。 白色通常是指反射…

    2019年11月24日 0 1.6K
  • 如何使用ImageJ保存Stack图片三维效果图

    众所周知,ImageJ可对Stack图像进行重建来构建三维立体模型。医学图像中CT层扫图片可重建为三维立体模型,共聚焦图片也可以进行Z-Stack层扫获得三维图片。最近有人问我如何使用ImageJ保存三维效果图,今天就给大家分享一些保存Stack图片三维效果的多种方法! ImageJ保存三维图片 1、ImageJ 1.50b File -> Open打…

    2019年11月22日 0 1.3K
  • ImageJ分析血管、神经元等网络结构必备技能

    前段日子,导师突然要求我分析叶脉的长度,这让不懂图片分析的我愁眉不展。但是,经过学习机智的我使用ImageJ顺利的解决了这一问题,甩给大家一个分析结果:   效果是不是很溜?今天给大家分享这个ImaegJ分析网络结构的必备技能,从此轻松分析血管、神经元等网络结构。   所需插件Ridge (Line) Detection Plugin,地址:htt…

    2019年9月6日 0 1.2K
  • ImageJ常见插件(CLAHE、VesselJ、AxonJ、LeafJ)使用方法

    前段日子,导师突然要求我对HE染色及电镜的轴突图片进行计数、分析血管密度等,这让我愁眉不展。但是,经过学习机智的我使用ImageJ顺利的解决了这些问题。ImageJ可自动、快速得到分析结果,今天就把这些科研中不得不知道的实用插件分享给大家!   一、CLAHE插件增强图像对比度 CLAHE (Enhance Local Contrast)插件可增强图像的局部…

    2019年7月31日 0 2.8K