HCMDB

  • 研究癌症转移工具:HCMDB(人类癌症转移数据库)

    HCMDB(人类癌症转移数据库)是一个集成数据库,可以存储和分析癌症转移的大规模表达数据。该数据库从GEO和TCGA中收集了124个先前公开的转录组数据集,用于比较转录组以检查转移相关基因的表达,在目前版本的HCMDB中,它包含来自四百多个实验的29种癌症类型。为了注释那些可能与转移相关的基因,数据库基于7,000多种已发表的文献,总共筛选了2183个基因(…

    2020年2月17日 0 74
  • 肿瘤转移数据的数据库工具HCMDB介绍及使用方法

    转移(Metastasis)是肿瘤进一步恶性发展时的一个重要特征,也是众多研究者手中项目的主题。笔者在研究肿瘤转移时,要么去查文献找基因,要么通过分析TCGA数据来寻找,但TCGA中的肿瘤转移的数据不多。   最近发现了一个专门收集整理了肿瘤转移数据的数据库工具——HCMDB,网址:http://hcmdb.i-sanger.com/index。该工具由华东…

    2019年11月1日 0 339

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