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标签:GEO

画图专题:热图pheatmap()函数-sci666
基础实验

画图专题:热图pheatmap()函数

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先看一眼这个函数的参数,这么多! 而且最后还有省略号! 那么我们应该怎么合理使用这些参数让你的热图看起来更加高大上呢? 数据准备: 此次例子,我们选择了一套GEO数据库的肺癌数据,数据编号为GSE19804,120个样本,其中包含60个癌症...

R语言实例操作分析GEO数据库甲基化芯片-sci666
生物信息学

R语言实例操作分析GEO数据库甲基化芯片

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小伙伴们,上次为大家解读了一篇GEO甲基化芯片相关的SCI文献,今天,小编打算带领大家用R软件实例操作分析GEO甲基化芯片。作为目前最大的芯片数据库,GEO数据库提供给我们了海量的数据,但是,错综复杂的数据交织在一起,如何选择数据是摆在我们...

如何利用迅雷高速下载GEO和UCSC Xena的数据-sci666
生物信息学

如何利用迅雷高速下载GEO和UCSC Xena的数据

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搞肿瘤研究的科研民工虽然基金竞争激烈,但因往往关乎人生命健康,所以其科学意义不言而喻。引用一句名言“地上的路;其实地上本没有路,走的人多了,也便成了路”,大概是肿瘤做的人多了,公共生物样本数据就很多,总显得比其他学科的人“家底殷实”。从公共...

使用DiseaseMeth 2.0进行甲基化分析-sci666
工具介绍

使用DiseaseMeth 2.0进行甲基化分析

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DNA甲基化,对于做科研的小伙伴们或多或少不陌生吧,而R语言复杂的代码加上报错也常常让小伙伴们怒砸键盘不已!今天,小编给大家分享一个神器,让你轻松搞定甲基化数据分析。当然,如果有小伙伴对甲基化概念不甚了解,可动动手去文末查看! 首先,还是上...

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