circRNA

  • 利用BIOINF设计circRNA的引物并检测其特异性(中文操作教程)

    今天我们来介绍一下circRNA的引物如何设计,以这篇文章(CircPrimer: a software for annotating circRNAs and determining the specificity of circRNA primers.BMC Bioinformatics. 2018 Aug 3;19(1):292. )介绍的工具Circ…

    2020年2月18日 0 144
  • 非编码RNA数据库总结

    是不是发现Starbase貌似一直登录不上? 是不是还在为非编码RNA的课题设计而发愁呢? 今天师兄给大家带来一篇非编码RNA生信工具大全以及课题设计文章,以前我们也分别介绍过不少非编码RNA数据库,像miRNA的,也有lncRNA、circRNA的。数据挖掘的工具也在不断发展,今天咱们系统地把miRNA、lncRNA、circRNA的所有最新、实用数据库介…

    2020年1月8日 0 357
  • 文献解读:miRNA通过AGO2调控circRNA表达

    circRNA通过吸附miRNA发挥作用的文章已经比较多了,今天我们来看一篇miRNA调控circRNA的文章: MicroRNA-1224 splicing circularRNA-Filip1l in an Ago2- dependent manner regulates chronic inflammatory pain via targeting U…

    2019年12月25日 0 434
  • 怎么把课题从microRNA研究过渡到lncRNA/circRNA?

    不可否认,lncRNA是继microRNA以后的大热点,这一点从文章和基金等都能看出来,那么,从研究microRNA过渡到lncRNA研究时要注意什么?   关于这一点,要从十年前说起了,那时的科研热点是microRNA,所以大家有很多课题都是microRNA与疾病关系的,而microRNA的作用机制,特别是对靶基因的调控机制研究套路是非常模块化的。所以,当…

    2019年12月16日 0 432
  • circRNA芯片数据分析之circRNA背景知识

    我前面说到过,如果你确实是第一次接触circRNA芯片数据,完全不用担心,你只需要把它看作是你不知道基因名字的mRNA芯片,最后得到的各种各样的分析结果,只不过是以circRNA的ID来表示而已。 虽然是一个ID,但是也是需要理解的,这里我们仍然是以 发表在Cancer Cell International,时间是 November 2019 ,标题是 A …

    2019年12月12日 0 362
  • circRNA高分文章的三个研究思路

    关于circRNA今年5-10范围的文章,我们之前给大家介绍了两种模式:一种是表达谱类型的文章,还有一种是circRNA作为ceRNA吸附miRNA调控靶基因和通路发挥功能,今天我们来看过10分的文章是怎么做的。 上次我们说2017年发表的10分以上的文章数量不到60篇,我们下面就总体梳理下这些文章的研究方向,总体来说,这些文章的研究可以分为三类: 1. 跳…

    2019年12月12日 0 466
  • 外泌体+lncRNA或circRNA申请基金思路

    今天咱们还是继续发干货,围绕SCI和基金展开,今天师兄讲的是热点的联合。 听很多平台的小伙伴讲单一的热点继续做下去,创新性逐渐下降(有一种饱汉不知饿汉饥的感觉),在发表文章和申请基金时都面临着压力,所以经常面临着实验做着做着热点就过了,等自己发文章时,这个热点只能灌灌水了,但是老板的要求又一点没减,随时面临加戏的风险。 那么索性来个A计划和B计划,事先把剧情…

    2019年12月4日 0 877
  • 文献解读:circRNA表达为什么升高?

    最近有朋友问我们一个问题: circRNA 差异表达的原因是什么呢?是不是像公众号前面介绍的文章:lncRNA差异表达的原因(上游机制)有哪些?(附文章分析)里面列举的(1)基因拷贝数变异(缺失或扩增)(2)转录因子、组蛋白修饰和DNA甲基化等和(3)转录后lncRNA稳定性调控呢?换句话说,circRNA表达异常的上游机制是什么呢? 下面我们通过一篇文章来…

    2019年12月2日 0 271
  • 利用BIOINF设计circRNA的引物并检测其特异性(含中文操作教程)

    今天我们来介绍一下circRNA的引物如何设计,以这篇文章(CircPrimer: a software for annotating circRNAs and determining the specificity of circRNA primers.BMC Bioinformatics. 2018 Aug 3;19(1):292. )介绍的工具Circ…

    2019年11月22日 0 427
  • 文献解读:结构化分析一篇23分顶刊文章

    Noncoding RNA主要包括miRNA,lncRNA及circRNA,是最近几年的热门研究领域。其广泛参与生命活动的各种调节过程,且不编码蛋白,又被称为生物界的暗物质。miRNA目前已经研究的相对成熟,其主要作用是结合在基因的3’ UTR区,负向调节基因的表达。   LncRNA及circRNA是近期研究的主要内容, lncRNA的作用模式目前主要有S…

    2019年11月19日 0 496