ceRNA

  • 文献解读:3分的ceRNA生信分析文章思路

    大家好,今天小编和大家文献解读的是1月份发表在Frontiers in Genetics(IF:3.517)杂志上的一篇文章,“Dysregulated lncRNA-miRNA-mRNA Network Reveals Patient Survival Associated Modules and RNA Binding Proteins in Invas…

    2020年5月18日 0 158
  • 最新ceRNA纯生信分析文献解读

    这篇文章发表在《BMC Cancer》上,杂志最新IF为2.933。文章从GEO数据库中找了两个非小细胞肺癌数据集,分别测了miRNA和mRNA。 首先做了两个数据集的PCA和差异表达基因火山图。 对于筛选出来的差异mRNA以及miRNA,从miRWalk中找到关系对,进行功能富集。 miRNA本身无法做功能富集,但是其靶向的mRNA可以。每个miRNA靶向…

    2020年4月23日 0 240
  • 文献解读:ceRNA网络在头颈部鳞状细胞癌的作用

    今天跟大家文献解读的是1月份发表在frontiers in oncology(IF:4.137)上的一篇文章。   Comprehensive Analysis of Competitive Endogenous RNAs Network, Being Associated With Esophageal Squamous Cell Carcinoma an…

    2020年2月20日 0 283
  • ceRNA综述、数据库及经典文章

    ceRNA机制揭示了一种RNA间相互作用的调控模式。ceRNA是一类具有miRNA结合位点,能够竞争性结合miRNA抑制其对靶基因调控的RNA。之前我们介绍过mRNA、lncRNA、circRNA以及假基因均可以作为ceRNA通过MREs来结合miRNA从而调控下游靶基因的表达。 一、ceRNA高分Review 1、Competing endogenous …

    2019年12月25日 0 397
  • 不做实验SCI论文发发发系列之——ceRNA网络

    今天来讲讲生信文章的套路,今天给大家分享一篇MOL BIOSYST(IF=2.78)上的生信文章,虽然MOL BIOSYST近年来影响因子有所下滑,但总体来说还是比较稳定的,并且审稿较快。 文章题目为“Reconstruction and analysis of the lncRNA–miRNA–mRNA network based on competiti…

    2019年5月16日 0 765
  • 文献解读:lncRNA作为ceRNA调控miRNA的研究思路

    今天给大家分享一下lncRNA作为ceRNA调控miRNA的发文套路,这里是做实验的,不是数据挖掘的,适合于搞基础科研的人,研究生开题,或者博士开题。 这种套路如下: lncRNA***作为ceRNA调控miR***促进***癌的增殖与侵袭转移   1、利用qRT-PCR验证lncRNA***在***癌组织中、***癌细胞株中是否高表达(分别与正常…

    文献解读 2019年1月30日 0 672