CellMarker

  • 生物信息学(生信分析)常见数据库与在线工具汇总

    数据库的挖掘能够提供科研思路,少走弯路,加速课题进展。对于不会编程的科研人员来说,点点鼠标就可以进行数据库挖掘与在线分析可以说是一股暖流。闲话不多说,上干货。      一. 高通量测序分析与可视化数据库 NCBI的GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds)。包含各种高通量测序的原始数据以及处理后数据。原始数据的分析需要…

    2019年12月27日 1 528
  • CellMarker细胞标志物(Marker)数据库

    细胞标志物(Marker)是我们用来对细胞定义和分选的重要标志,特别是随着单细胞测序技术的普及,当我们对组织内的细胞进行检测并进行TSNE聚类后,我们通常会面临一个问题:特异性表达某些基因的这类细胞有什么特性?或者我要看一下上皮/内皮/B细胞/T细胞/干细胞/成纤维细胞等不同类型细胞的Marker的表达情况,可是这些细胞的Marker基因是什么呢?这时如果有…

    2019年12月3日 0 232
  • ​细胞定位及标志物数据库(Brain RNA-Seq、脑、肺血管单细胞数据库、CellMarker)

    2019年9月Cell发表了一篇重磅研究【1】,该研究鉴定出定位于少突胶质细胞的高尔基体“前哨”细胞器的的特异性标记物TPPP(Tubulin polymerization promoting protein),揭示了TPPP在髓鞘形成等方面的重要功能以及微管组织方式的详细分子机制。   那么作者是怎样筛选出非常特异地表达少突胶质细胞中的TPPP的呢?今天半…

    2019年11月15日 0 515

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