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标签:热图

画图专题:热图pheatmap()函数-sci666
基础实验

画图专题:热图pheatmap()函数

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先看一眼这个函数的参数,这么多! 而且最后还有省略号! 那么我们应该怎么合理使用这些参数让你的热图看起来更加高大上呢? 数据准备: 此次例子,我们选择了一套GEO数据库的肺癌数据,数据编号为GSE19804,120个样本,其中包含60个癌症...

通过MeV(Multiple Experiment Viewer)绘制聚类热图-sci666
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通过MeV(Multiple Experiment Viewer)绘制聚类热图

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聚类热图是我们展示芯片、或者测序结果比较常用的方式,在文章中出现的频率非常高,一般来说,这张图的每行对应一个基因,每列对应一个样本,行和列形成的是基因数*样本数的表格,接下来用不同的颜色代表基因在样本中的表达量。颜色的设置有很多种,一般常见...

使用DiseaseMeth 2.0进行甲基化分析-sci666
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使用DiseaseMeth 2.0进行甲基化分析

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DNA甲基化,对于做科研的小伙伴们或多或少不陌生吧,而R语言复杂的代码加上报错也常常让小伙伴们怒砸键盘不已!今天,小编给大家分享一个神器,让你轻松搞定甲基化数据分析。当然,如果有小伙伴对甲基化概念不甚了解,可动动手去文末查看! 首先,还是上...

零代码画热图——ClustVis-sci666
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零代码画热图——ClustVis 利用ClustVis画热图

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一  前言 在生信的分析学习过程中,对结果的可视化是非常重要的,在很多生信文章常见体现聚类等差异的就是热图,PCA等图。 但是在画图之前,我们需要知道:什么是热图,什么是PCA分析图?我们这么做的目的是什么?那么画热图和PCA分析图的意义和...

GEO|TCGA|Oncomine数据挖掘教程(医学方)免费下载-sci666
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GEO|TCGA|Oncomine数据挖掘教程(医学方)免费下载

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适用人群 对基因数据挖掘充满兴趣的医学工作者及科研人员 课程概述 你是否还为没有文章毕业而焦虑?你是否还为实验结果不尽人意而沮丧?你是否也想足不出户就可以完成一个小课题?这些零零种种的困扰和幻象,相信不会发生在一个人身上。那么今天,我们可不...

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