工具介绍

  • PubMed使用者指南(一)

    学习一个工具最直接有效的方式就是阅读它的官方指南,今年我们来学习一下PubMed的最新指南。 更新时间:2020年6月16日 常见问题 1.我怎样获得全文?如果全文链接失效该怎么办? 2.我怎样通过作者检索? 3.我怎样通过期刊名检索? 4.通过一些信息比如作者、期刊名和出版时间,我怎样找到特定的引用? 5.我检索了太多引文,如何集中? 6.我检索了太少引文…

    2020年8月5日 0 5
  • PubMed使用者指南(二)

    今天带来pubmed使用者指南第二部分 原文链接 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/ 展示、排列和导航 1.理解你的检索结果 2.展示一个摘要 3.改变检索结果的展示形式 4.展示更多的结果 5.对结果进行排序 6.查找全文文章 7.相似的文章 8.引文 9.被引用 10.使用Linkout查找相关资源 11.报告问题…

    2020年8月5日 0 5
  • PubMed使用者指南3.0

    继续翻译 今天是关于引用 保存 分享的部分 用剪贴板暂时保存引文 剪贴板提供了一个可以保存来源于不同研究引文的空间,最多可达五百条。存储于剪贴板的引文在八小时的静止状态后会过期。 向剪贴板添加引文: 1.使用检查框在你的搜索结果中选择引文。如果保存所有的结果(最多500条),不要标记任何检查框。 2.选择“发送”按钮,然后选择”剪贴板“。 3.选…

    2020年8月5日 0 5
  • 蛋白相互作用数据库总结(2):IID与BioGRID

    上一期我们介绍了两个蛋白相互作用数据库STRING和InBio Map两个蛋白相互作用数据库。这次我们再介绍两个。 IID(http://iid.ophid.utoronto.ca/SearchPPIs/protein/)。             之前的数据库只能精确到物种里面的蛋白相互作用。而IID呢。则是可以器官特异性的蛋白相互作用数据库。用法呢也是非…

    2020年8月4日 0 30
  • 蛋白相互作用数据库总结(1):STRING与InBio Map

    每一个个体都要和其他人进行联系才能发挥更大的作用,基因就和人一样,基因之间也是通过基因之间的相互作用完成功能的。那么我们在研究自己的基因的时候,要怎么才能知道哪些基因和我研究的基因相互作用呢。网上有很多的蛋白相互作用数据库。这次就为大家介绍介绍几个蛋白相互作用数据库,方便大家进行查找比对。             下面就分三期给大家逐个介绍一下数据库的使用 …

    2020年8月4日 0 33
  • 人类蛋白免疫组化表达数据库

    写在前面 我们在进行基因的蛋白表达检测的时候,通常的方法是进行western blot以及免疫组化进行检测的。对于这两个实验都是需要提前买抗体进行检测的,但是抗体又贵,如果一个基因检测的结果不好的话,那有可能就要浪费这个抗体了。所以今天就来介绍一个,在很多癌症当中做了很多基因的免疫组化的数据库: The Human Protein Atlas (https:…

    2020年7月16日 0 249
  • Origin如何提取图片数据

    导言 有些时候,我们在看文献,想看看作者的实验数据,但是我们只有图;又或者自己的实验由于某种原因,只剩下图片了,数据不见了,这种情况该怎么办呢? 今天,我们来使用万能的Origin软件进行数据的提取,方便大家用来以防万一,或者去进行别人文献数据的提取。 图文教程 下来我找到了一张文献中的粒径测量图,我们以此来演示一下如何获取图中的数据。   参考文…

    2020年7月16日 0 151
  • 肠道菌群数据库

    写在前面 肠道菌群在最近的几年也开始成为了我们的研究热点。对于肠道菌群的研究,基本上就是先通过宏基因组测序来分析不同分组之间的肠道菌群的变化。之前刚开始研究的时候,都是自己测序自己分析的数据。随着研究进程的延长以及相关文章的发表。一些其他团队发表测序的结果也会逐渐的公开到网上。由于数据的增多,所以也就可以拿网上的数据来进行汇总分析了。这个就有了我们今天要介绍…

    2020年7月16日 0 136
  • ExoBCD:乳腺癌外泌体相关生物标志物的综合数据库

    今天给大家分享一个最新的乳腺癌外泌体标记物数据库:ExoBCD。研究乳腺癌外泌体相关的小伙伴们可以一起来围观围观。现在我们来看看数据库构建的整体思路和所包含的哪些信息。ExoBCD数据库链接:https://exobcd.liumwei.org. 1. 简介 肿瘤标记物的准确应用是提高肿瘤患者治疗有效性和安全性的关键,外泌体作为“液体活检”和生物标记物的新来…

    2020年7月2日 0 226
  • 肿瘤药敏多组学数据库(GDSC)的数据介绍和获取

            在第一期的GDSC数据总览中,我们根据数据库的模块进行总体的介绍。今天我们再深入了解GDSC所包含的数据及其获取的方法,也就是GDSC的数据下载模块。         GDSC数据下载的模块,分为4个模块,分别是ANOVA results、drug data、genetic features和bulk data。在分析中常用药物筛查IC50数…

    2020年7月1日 0 212