工具介绍

  • 利用AI(Adobe Illustrator)画冠状病毒示意图教程

    前言 近期有关于冠状病毒的信息很多,相关学术论文数目也在不断增加。为了让论文好看一点,今天我们来使用AI画一个冠状病毒,练习练习Adobe Illustrator的画图技巧。 软件 Adobe Illustrator CC 2019 图文教程 1. 打开AI软件,建立一个适合自己的模板 2. 下来我们先画一个冠状病毒的棘突糖蛋白,由一个圆形(添加深蓝色渐变)…

    2020年2月15日 0 207
  • 利用miRWalk预测miRNA的靶基因教程

    身处一个朴实(穷逼)低调(无课题)的实验室,老板总教育我们要花最少的钱,发最多的paper。最近他给了我一个miRNA,并告诉我这是一颗SCI 的种子,让我小心浇灌,争取早日成材。木得办法,富人找公司,穷人上百度,我开始了以下愉快的(艰难的)探索真理奥秘(努力少花钱发paper)之旅。 首先,我预测了这个miRNA的靶基因,打开miRWalk 3.0: ht…

    2020年2月14日 0 50
  • 利用新版PubMed挖掘医学、药学研究信息方法

    美国国立医学图书馆(NLM)下属的美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发研制的网络数据库。NCBI收录文献范围广:医学、药学、生物、保健、护理、牙科、中医药等,免费提供题录和文摘,提供与原文的网址链接。 NCBI提供了28个免费数据库,PubMed只是其中一种。 PubMed有哪些数据内容呢?   MEDLINE 记录中用[indexed for…

    2020年2月12日 0 51
  • 基于Chrome的新版PubMed优化方法教程

    之前先是写了新版PubMed的“新”,接着了解到一些同学的需求,那么,这篇文章就是趁着新版PubMed完全体来了,给大伙说下体验及PubMed优化策略(包括各位期待的chrome插件安装部分)。 一、新版PubMed正式投入使用 如之前NLM的时间计划,新版PubMed已正式开始投入使用。 NCBI账号可登陆,过滤条件亦可操作。 这意味着新版PubMed已经…

    2020年2月12日 0 52
  • IRIS-EDA:网页版RNA-seq、WGCNA分析工具

    此前白介素同学写过一些关于 RNA-seq数据的网络分析神器,又名碉堡的神器系列: 私下还有小伙伴批评我用词不雅,这次就改称网页版神器好了。还写过一期关于单细胞测序数据分析工具: 主要是集中了主流的分析软件。但是,To our knowledge, 目前为止还没有关于单细胞测序数据分析的网页工具,这次白介素同学分享一个重磅网页版神器,这里的RNA-seq,不…

    2020年2月11日 0 54
  • 人类蛋白质参考数据库HPRD介绍

    今天给大家推荐一个非常全面的网址——HPRD,全名是人类蛋白质参考数据库(Human Protein Reference Database)。该数据库是目前最大的人类蛋白相互作用数据库,包含30000多个蛋白质和41000对条相互作用信息。除了包含蛋白相互作用信息,HPRD还囊括了蛋白注释、亚细胞定位、结构域、转录后修饰和信号通路合集等多种功能。话不多说,下…

    2020年2月9日 0 70
  • 浙江大学出品TSVdb:TCGA中的可变剪切分析工具

    分子生物学里有一个概念叫“顺式剪接”,意思是在同一个基因内,切除内含子,使相邻的外显子彼此相连的剪接方式叫做顺式剪接。   因为内含子和外显子有多个,所以如何“剪”和“接”也就形成了一个新的科学问题——“可变剪接”。   一条未经剪接的RNA,含有多种外显子,可以被剪成不同的组合,可翻译出不同的蛋白质。就能将同一基因中的外显子以不同的组合方式来表现,使一个基…

    2020年2月2日 0 35
  • CancerSplicingQTL:人类全基因组鉴定癌症剪接数据库

    古语有云:君子性非异也,善假于物也。特别是在当今各种测序手段不断改进,大数据逐步来临的时代,借助别人测序获得的结果或许会对我们的研究起到事半功倍的效果。今天笔者给大家推荐一个非常好用的人类全基因组鉴定癌症剪接数据库——CancerSplicingQTL,希望大家能喜欢。   在癌症的发生、发展、预后和治疗过程中经常观察到异常选择性剪接(AS)模式。这种异常选…

    2020年1月23日 0 67
  • 单细胞测序数据分析工具包集合

    随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集的逐渐累积,用于分析这些数据的工具数量也在急剧增加。熟悉小张聊科研的同学都知道,此前小编大大们曾预言,2019将迎来单细胞测序数据的大爆发。 此前也推送过一些数据库,那接下来咱们关心的问题是数据如何分析,需要应用哪些工具软件,早已有大佬们帮咱考虑到这个问题啦,特意开发了一个数据库,专门集中这些工具,整合起来方便…

    2020年1月21日 0 103
  • 人类疾病相关的翻译后修饰数据库:PTMD

    我们知道各种翻译后修饰(PTM)通过调节蛋白质功能来参与许多生物学过程, 并且PTM的异常经常与人类疾病有关系。在很多研究中我们都要用到与疾病相关的PTM,下面我们来介绍一个数据库,帮助我们快速获取与人类疾病相关的翻译后修饰—PTMD http://ptmd.biocuckoo.org 在具体使用上,可以通过PTM和疾病类型这两种方式进行浏览。 …

    2020年1月20日 0 60

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