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工具介绍

单细胞测序数据分析工具包集合-sci666

单细胞测序数据分析工具包集合

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随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集的逐渐累积,用于分析这些数据的工具数量也在急剧增加。熟悉小张聊科研的同学都知道,此前小编大大们曾预言,2019将迎来单细胞测序数据的大爆发。 此前也推送过一些数据库(自己做不起单细胞测序,别担...

人类疾病相关的翻译后修饰数据库:PTMD-sci666

人类疾病相关的翻译后修饰数据库:PTMD

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我们知道各种翻译后修饰(PTM)通过调节蛋白质功能来参与许多生物学过程, 并且PTM的异常经常与人类疾病有关系。在很多研究中我们都要用到与疾病相关的PTM,下面我们来介绍一个数据库,帮助我们快速获取与人类疾病相关的翻译后修饰—P...

头颈癌数据库HNCDB使用介绍-sci666

头颈癌数据库HNCDB使用介绍

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头颈癌(HNC)是全球第六大最常见的癌症。在过去的十年中,已经为HNC积累了大量经过批注的基因和药物数据。但是,通过查文献逐步寻找相关基因与药物费时费力。 因此,我国中山大学肿瘤防治中心的一个研究团队构建了头颈癌数据库HNCDB,通过整合P...

利用Web of Science创建引文、期刊和检索词跟踪-sci666

利用Web of Science创建引文、期刊和检索词跟踪

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在科研圈的合作与竞争中,获取学术情报的质量和速度至关重要。想第一时间知道自己研究领域的最新进展?关注的论文和自己发表的论文又被哪些人引用了?感兴趣的学术大牛最近又发了哪些文章?以上这些情报,除了能够帮助我们了解领域最新进展、寻找研究思路突破...

Swissdock:预测小分子-化合物的对接的网站-sci666

Swissdock:预测小分子-化合物的对接的网站

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是不是国家、省、市级的标书要开始了?是不是前期研究基础看上去…..不那么高大上?是不是在想找一种图科主任看了不知道所云的图?给大家推荐一种看上去很高大的图:小分子化合物–蛋白对接构象图。做出来的效果如下图。   不要在...

Labome:在线抗体快速选择网站-sci666

Labome:在线抗体快速选择网站

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“实验千万条,抗体第一条,抗体选不对,结果两行泪。”   生物研究怎么离得了抗体?无论是 WB 还是 IP,亦或 ChIP 或者免疫组化,抗体都是重中之重。可是寻找靠谱的抗体却并非易事。如果你只是简单地在搜索引擎里输入“某某抗体”...

miRPathDB:全新的MicroRNA-Pathway数据库-sci666

miRPathDB:全新的MicroRNA-Pathway数据库

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在我们聊miRNA套路之前,梦熊先安利一款miRNA/pathway研究的数据库:miRPathDB 该数据的主要功能是查询参与通路内调控的miRNAs,包含了人、鼠两类数据。 主要有三类功能: 分析每条miRNA结合不同位点相关的通路 分...

Remap:NCBI官方基因组坐标转换工具-sci666

Remap:NCBI官方基因组坐标转换工具

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首先这是一篇实用贴,做基因组学研究的朋友们也许经常会碰到准确获取基因或者某一功能位点在基因组上的位置的问题。   随着人类基因组计划的完成,这项工作理论上很好解决,但问题是随着基因组数据的不断完善,序列信息在不断更新,所以我们经常...

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