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  • 约束聚类-多元回归树及重要判别变量识别及R操作

    约束聚类-多元回归树及重要判别变量识别及R操作 前文已简介了决策树,其基本思想是对预测变量进行二元分离,从而构造一棵可用于预测新样本单元所属类别的树。常规的决策树中,响应变量只包含单变量的分类或定量变量,因此也称为一元回归树。 多元回归树(multivariate regression tree,MRT)是一元回归树的拓展,可用于描述和预测两个变量矩阵间的关…

    2020年2月25日 0 7
  • R包randomForest的随机森林分类模型以及对重要变量的选择

    R包randomForest的随机森林分类模型以及对重要变量的选择 随机森林(random forest)是一种组成式的有监督学习方法,可视为决策树的扩展。 随机森林通过对对象和变量进行抽样构建预测模型,即生成多个决策树,并依次对对象进行分类。最后将各决策树的分类结果汇总,所有预测类别中的众数类别即为随机森林所预测的该对象的类别,分类准确率提升。 随机森林工…

    2020年2月25日 0 7
  • R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图

    R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图 聚类树与柱形图结合,即可反映样本或分组间的相似性,又能展示样本内的元素组成信息。 例如下图是一个在扩增子测序微生物群落分析中常见的统计图类型,在测序公司给的报告中通常都有这么一张图。聚类树表示了各样本或分组之间,物种丰度组成的相似性或相异程度;柱形图就是常见的物种堆叠柱形图,常用于表示代表性的门纲目科属等丰度,如下图中即展示了…

    2020年2月25日 0 8
  • 决策树的分类模型及对重要变量的选择及R操作

    决策树的分类模型以及对重要变量的选择及R操作 何为决策树,比方说下面这种。 当然这个判断依据是我瞎画的,真实情况可能不是这样,看看就好别较真……总之在这个非常时期,好好听党和政府的话,尽可能不要外出就可以了。   好了回到正题,上述就展示了一个简单的决策树,根据某人是否有发热症状或者有无接触可疑人员等,是否需要被强制隔离。在每个节点处都有一个二元判别项,根据…

    2020年2月25日 0 8
  • 网络分析概述之网络基础简介

    网络分析概述之网络基础简介 从本节开始介绍网络分析。本篇暂且对网络概念作个初步简介,随后的章节再一一展示怎样分析数据。根据白鱼同学目前比较熟悉的领域,今后的章节主要以“微生物互作网络”、“基因共表达网络”为例作阐述。 注:该“网络”是指数学中分析数据的一种方法,不是“互联网”,也不是“神经网络”之类的。    网络基础概述 何为网络,及其基本结构 在数学中,…

    2020年2月25日 0 5
  • 网络拓扑结构-节点和边特征的简介和R计算

    网络拓扑结构-节点和边特征 前述网络基础概述中提到,在数学中,“网络”(networks)通常被称为“图”(graphs),一个图G=(V,E)是一种包含“节点”集合V与“边”集合E的数学结构,其中E的元素是不同节点的无序组合{u,v},u,v∈V。同时,对网络的基础要点做了简介。 网络图中的基本元素是节点和边。当元素存在于网络结构中时,会被赋予一些重要的“…

    2020年2月25日 0 8
  • StatQuest生物统计学:中心极限定理

    大数定律揭示了大量随机变量的平均结果,但没有涉及到随机变量的分布的问题。而中心极限定理说明的是在一定条件下,大量独立随机变量的平均数是以正态分布为极限的。——Wikipedia 大数定理:虽然在每次随机试验中出现的结果不尽相同,但是随着大量重复试验的数量增加,其结果(均值)逐渐趋近于一个确定的值。 中心极限定理(Central Limit Theorem)是…

    2020年2月25日 0 9
  • transplantation影响因子3分的外科期刊

    期刊概况 今天给大家推荐一本审稿快的外科优秀期刊transplantation,根据中科院SCI期刊分区,大类中属于医学 2区,小类中属于免疫学2区,外科1区,移植2区。期刊内容以论著为主,其它类型文章约占5-10%,接受个案报道。             影响因子 影响因子一直在3分左右波动着,低的话也没有低于2.5,近两年有上涨的趋势,目前已过三分,期刊…

    2020年2月25日 0 11
  • 中国实施的新冠肺炎遏制措施有效 传播速递在放缓

    美国杜兰大学的杰出教授James “Mac” Hyman正在使用数学模型更好地理解和预测COVID-19的传播,并且定量确定了制止这种疾病的各种措施的有效性。Hyman在杜兰大学科学与工程学院的研究目标是帮助公共卫生界了解和预测2019-nCoV感染的传播,并评估控制它的不同方法的潜在有效性。Hyman和他在美国乔治亚州立大学和加拿大…

    2020年2月25日 0 8
  • Bio-Design And Manufacturing影响因子预测4.5分

    虽然近日国家教育部科技部联手否定“SCI至上”,但对于一个做科研的学生或学者而言,SCI论文依旧是体现科研价值的重要指标。 我们今天给大家介绍优质的国产SCI期刊,Bio-Design And Manufacturing(BDM)。 官方网站:https://www.springer.com/journal/42242。 由浙江大学机械工程学院、浙大出版社、…

    2020年2月25日 0 17

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