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SymMap:中药症候关联数据库

前天给大家推荐了ETCM这个号称中药百科全书的数据库,留言区里有同学问我全吗?我就问了一下学中医的同学,他们给我推荐了另外一个数据库,说是这个数据库收录了中国药典中499种草药。

我想今天分享给大家吧,两个数据库结合着看,应该就比较全面了。
SymMap
网址是:https://www.symmap.org/
SymMap:中药症候关联数据库
SymMap通过连接分子机制和外部症状,将中药(traditional Chinese medicineTCM)与现代医学(modern medicineMM)紧密联系在一起。数据库包含499种在中国药典中注册的草药,其中包含19,595种成分,以及1,717种在中药中使用的相应症状(TCM症状),并且将这些中医症状严格映射到现代医学中使用的961个症状术语(MM症状)。此外,SymMap通过症状疾病关联或成分靶标关系收集了这些草药的相关靶标(基因)和疾病。 SymMap总共包含了4,302个靶标和5,235个疾病。
SymMap:中药症候关联数据库
当前,SymMap提供有关草药,中医症状,MM症状,成分,靶标和疾病的大量描述性信息。它还通过直接关联或间接统计推断在所有这六种类型的组件之间提供成对关系。总之,它显示了一个用于所有六个组件之间集成关系的网络。
SymMap:中药症候关联数据库
ETCM数据库比较类似,数据库也提供了浏览和搜索的选项,数据库的六个组成都可以进行搜索。选取Herb,可以看到重要的中文名称和药物特性分类。比较形象,比如巴豆就是攻下药,巴戟天是补阳药。
我们拿巴豆作为例子来看看,这个数据库的妙用。
SymMap:中药症候关联数据库
点击巴豆的Herb id就能进到详细介绍页,上半部介绍了巴豆的名称、分类和功能,往下拉就能看到该草药与六大组成之间的关系图。
SymMap:中药症候关联数据库
我们可以看到六大组成构成了一个巨大的环形,草药对应了哪些中医症状,这些症状在现代医学中又是如何表示,对哪些疾病有治疗效果。同时,草药中的有效成份对应哪些靶标,这些靶标又影响了哪些疾病,都被这些草蛇灰线串联了起来。点击右上角的Download按钮,就可以把这个酷炫的图下下来了。
SymMap:中药症候关联数据库
再往下拉,就能看到图中每一个球代表的意义了,也可以下载下来进行分析。具体的内容和如何深入挖掘,大家可以参考下面这篇2018年的文章。
SymMap:中药症候关联数据库
以上就是今日份的分享,希望对大家有用。
参考文献:
Wu Y, ZhangF, Yang K, Fang S, Bu D, Li H,Sun L, Hu H, Gao K, Wang W et al: SymMap: anintegrative database oftraditional Chinese medicine enhanced by symptommapping. Nucleic Acids Res2019, 47(D1):D1110-d1117.

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