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m6A数据库总体评价介绍

数据库汇总

通过对昨天检索到的的20个得到的数据库进行整理总结,我们发现一共有19个是和m6A相关(没有关系是因为在摘要当中也提到了m6A,所以我们也就提取到了),在19个里面有一个数据库已经停止使用了,所以剩下了18个数据库和m6A相关。下面就对这18个数据库进行总结。

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由于我们在使用昨天使用pubmed检索的时候,检索的是所有在摘要当中出现网址同时满足数据库命名方式的结果。这些结果里面包括的数据库不仅仅只有网络在线的数据库,也包括一些基于编程语言的算法或者分析方法的软件,例如我们之前介绍评价RNA-seq当中APA事件的算法就是这种文章形式。这些发表算法或者分析流程的数据库文章,都会把自己写的代码上传于一个叫做github的网站。所以要我们其实在检索结果的网站当中发现带有github的结果,就知道这个数据库是需要代码来进行操作的。

m6A数据库总体评价介绍

由于我们的公众号的目标还是在线数据库,所以也就不打算讲这些需要代码来进行运算的数据库。

在线数据库总体介绍

由于m6A是基于核苷酸序列来进行调控的,类似这种的数据库发展方式,其实都是先有了基于核苷酸序列预测调控位点的数据库,然后再有了基于相关测序数据来分析的数据库,进一步的,又可以继续延伸出各种各样的数据库。这种的发展其实在我们之前APA事件汇总的数据库上也是能看到这样趋势的,这次的这个m6A也是一样的。

m6A数据库总体评价介绍

简单评价

通过对以上这些数据库的总结,发现这样检索到的数据库相对来说还是挺准确的。所以大家以后想要检索目标数据库的时候,可以试试在pubmed上直接检索文章的这种方法。

总体上我们对目前有的m6A的数据库做了一个简单的汇总。从明天开始就把相关的数据库来都做一个基本介绍吧。明天就先介绍序列分析相关数据库吧。

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