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PubMed文献检索的详细技巧方法

众所周知,不论是综述的撰写,还是文章标书的研究背景,都需要大量的文献支持。因此,如何能在尽量短的时间内尽量全面并且精炼的检索到所需文献,是困扰好多小可爱们的究极难题。

然鹅,每当有了一个 topic 后,老板和师姐只会告诉你,去搜一搜相关文献,并不会讲如何更有效率的完成这样一件听起来简单,做起来困难的事情。

于是,笔者带着之前的小本本,系统总结了一些关于 PubMed 文献检索的基本知识。那么,下面我们就一起来看看吧~

一、重新认识 PubMed

1. 检索条件:

新版的 Pubmed 界面真的是非常不友好,我们先点击「Advanced」进入高级检索界面,点击并查看下拉栏,会出现一堆眼花缭乱的英文。

PubMed文献检索的详细技巧方法

来源:网页截图

其中,我们常用的检索条件主要包括:

「自由词、规范主题词(MeSH)、文献作者、期刊名称、文献出版年代、文献类型、文献语种、物质名称」 这几类。

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2. 自由词与规范主题词:

1)自由词检索,即是输入与检索信息相关的任意词(组),检索的结果为文献题名内和摘要内包含输入单词的文献。

2)而规范主题词检索则是规范化的检索语言,它对文献中出现同一概念词汇的书写形式具有严格的规范控制。PubMed 中的规范主题词为 MEDLINE 数据库中规范化的 MeSH。

3)需要注意的是,PubMed 界面具有智能检索的功能,对输入的每一个自由词它将会自动进行自由和规范主题词双重检索。

举个栗子:

如果我们想在数据库中搜索维生素 H 相关文献,直接在「All Fields」中输入「vitamin H」。

我们的实际检索式为:

“biotin”[MeSH Terms] OR “biotin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields]

Ps. Biotin 为 vitamin H 的规范化 MeSH。

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3. 主题词数据库检索:

自由词检索,往往会由于初步检索词汇的宽泛,导致输出结果过多,不方便整理。这时我们可以使用主题词进行检索,但是很多词语我们往往不知道他的规范主题词是什么,这时候就可以借助主题词数据库进行检索

新版主题词数据库的进入方式:

在 Pubmed 主界面的右下角选择「MeSH Database」→「NLM MeSH Homepage」→「Browser Instructions」→ 「MeSH Browser 」,当然,嫌麻烦也可以直接从下图的网址(https://meshb.nl.nih.gov/search)直接进入(保持微笑.JPG)

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比如我们继续以「vitamin H」搜索,就会出现下方图片的检索结果,发现它的规范主题词是「Biotin」。

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二、其他检索方式

1.  作者途径检索:

利用文献「作者途径」在 PubMed 中检索时,作者名字的输入格式为在前、名在后,作者的姓用全称,作者的名用名字首字母缩写形式,而且不用加标点。

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2. 期刊名称检索:
 
利用文献「来源期刊名称」检索时,刊名既可以是全称,也可以是 MEDLINE 刊名标准缩写。
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但需要注意的是:
1)有些期刊名同时也是主题词,比如:Cell。所以这样的期刊名称在搜索时需要加上刊名标识符 [ta] 进行限定。
2)刊名中带有括号的,可以将括号省略不输入。
3)最后一招,还可以通过国际标准连续出版物代码,是的,没错,就是使用看起来很眼熟但是不知道全称的 ISSN 代码来查询,这样可以准确的查询到绝大多数期刊。
3. 截词检索:
 
通配符「*」可以添加在检索的单词或者词根之后,可以检索出所有含此单词和词根开头单词的全部文献。
 
这里需要注意的是:
1)配符最多同时可以对一个词根开头的前 150 个单词进行检索。
2)通配符检索只能搜索出以这个词根扩展出的全部「单词」,而不能检索此词根开头的「词组」。
3)截词检索时会自动关闭 Pubmed 的智能 MeSH 检索功能。
4. 词组检索:
 
可以使用双引号“”来检索词组索引表中未收录的词组。比如“lemon tree”就是词组检索。
这里需要注意的是:采用词组检索时,同样会自动关闭 PubMed 的智能 MeSH 检索功能。
 
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三、布尔逻辑运算检索
布尔逻辑运算检索其实就是几个连接词「AND」「OR」「NOT」和圆括号()的使用,通过组合不同检索词,并使用圆括号调换连接词的顺序来完成多重限定检索。
布尔逻辑运算连接词的顺序,正常来说是从左到右。但当检索式中有非限定的词组时,PubMed 就会自动检索该词组,而不是简单的将各词进行布尔逻辑组合检索。
举个栗子:
如果直接输入「air bladder fistula」,PubMed 会把「air bladder」当做一个词组优先检索,再将这一词组与「fistula」组配检索。
如果不想进行这种词组识别,要输入「air and bladder and fistula」利用布尔逻辑连接符取消这一自动词组转换。

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