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数据可视化的在线、本地简易制作——ImageGP和EasyCharts

毕业答辩临近,数据在手,但如何给数据弄出一个比较好的视觉呈现,且操作比较简单,也许是我们正需要的。

今天给大伙分享两个数据可视化利器:ImageGP和EasyCharts。

一、在线制图——ImageGP

这是由生信宝典团队开发的在线绘图工具,包括多种形式的热图、线图、柱状图、箱线图、泡泡图、韦恩图、进化树、火山图、生存分析等,这些都是基于R代码或简便封装的R脚本,简单,实用。即是人家已经把R代码写好了,就等你数据和设置了。

目前,需注册账户,即可解封该网站的在线制图功能。

网址:http://www.ehbio.com/ImageGP/

网站的整体视图:

支持制作图的完整列表:

 

1.支持的数据格式

官网显示,支持的输入数据格式有两种:

一、Wide format。每一列对应着一个变量,可见下图示例。

二、Long format。常见的基因表达矩阵一列为GeneID, 一列为Group,再一列 为value,分别对应着基因在对应样品的表达量。

若对网站的输入数据结构不太熟悉,读者可结合网站给出的Demo默认输入数据,试下模仿其格式编辑自己的数据,逐渐上手。注意表格类输入数据要以tab分割。

 

2.制图界面

如下图,提供数据和必选参数就可提交了。如果想更多调整布局和增加元素,可在对应版块针对性修改。

出图后,成功绘出的图片会显示在页面下方,并提供下载功能,可下载图的PDF格式。此外,出图后,可继续调整参数,以满足需要。

鉴于篇幅有限,可制作的图较多,但制作方法都比较简便,故读者们可以结合自身对图的了解,以及网站给出的Demo数据和设置,可以慢慢探索和研究。

二、Excel辅助能手——EasyCharts

谈到Excel,相信读者都不会陌生,这个Microsoft家的强大数据处理软件,数据处理能力异常强大,但其制作出来的图表往往难以适用我们的学术用途,主要有三点:

1.配色难看;
2.图中的背景、比例臃肿;
3.图标出来后,后期需要调整的工作量也大;

为此,EasyCharts应运而生。它是EasyCharts团队使用C#语言编写的一款Excel插件,主要用于数据可视化与数据分析,目前是1.0版本。

功能如下:

1. 专业图表风格的转换

使用Excel绘制图表后,选择“背景风格”中的项目“R ggplot2”、“Python Seaborn”、“Matlab 2014”等图表风格,自动实现图表背景风格的设定与转换,即把R、Python、MATLAB的图表风格转到Excel;

2. 适宜配色的转换

使用Excel绘制图表后,选择“颜色主题”中的项目“R ggplot2 Set1”、“Python seaborn hsul”等颜色主题,可以实现R、Python颜色主题的自动转换;

3. 数据分析的自动实现

使用“数据分析”命令可以实现频率直方图、核密度估计图、相关系数矩阵图、Loess数据平滑和Fourier数据平滑等数据的分析与图表的自动绘制;

(安装文件里面有极为详细的数据示范)

4. Excel辅助工具的使用

“辅助工具”包括颜色拾取、数据小偷、色轮参考、图表保存、截图等功能,尤其是“数据小偷”可以通过读入现有的柱形图或曲线图,自动或手动的方法,读取并获得图表的原始数据。 

关于程序的安装,笔者也为各位准备好了。

1、安装文件

2、安装方法

(安装文件里面会有详细的安装教程和视频、以及制图的数据演示)

为此,笔者在这里,主要是带大伙走下安装流程。

下载安装文件后,记得先点击“EasyCharts插件下载和安装说明”,它会带领你走完整个安装流程。

安装教程也是比较明了。值得注意的一点,在安装插件时:以管理员身份运行  “Excel图表exe安装包Excel图表exe安装包.exe”(可在安装包的“属性”中设置兼容性和“以管理员身份运行此程序”,永久解决)。

 

安装插件插件成功后,然后,打开Excel,就会出现如下界面,点击安装就好。

安装完成后,即可看到进入Excel后的界面,是这样的。 

使用这一块,大伙可以结合安装文件夹中的插件案例进行学习,操作也是比较简单。

以上,就是笔者关于这两款制图工具的分享。

 

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