1. sci666首页
  2. 实用技巧
  3. 工具介绍

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

Image J是一款功能强大的图像处理软件,在生物数据分析中应用极为广泛,重点是该软件是免费开源的!Fiji是包含了很多不同功能插件的Image J,即加强版的Jmage J,因此为了使用方便,建议大家直接下载Fiji。

           如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

在我们利用荧光显微镜获得一张图像后,该如何更漂亮的、更专业的给老板和同实验室的小伙伴展示呢,之前我跟大家分享一套常规操作,点击这里可以查看:利用Image J的Fiji插件展示荧光显微镜图像

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

Combiner功能

今天介绍新的内容,讲一讲Stacks板块下有哪些实用的功能。假设我们只有一张Merge后的图片,我们如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示呢?

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

我们要用到Image-Stacks板块中的Combiner 

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

Combiner可以将两个或多个序列文件以水平或者竖直的方向排版在一张图像上展示,如下,在Fiji中打开一张包含两个通道(红色和绿色)、z轴包含25层的stack文件,图像基本信息会展示在如下红框中 C:1/2 代表共有两个通道channel,现在显示第一个通道的图像;z:1/25代表一共25层,现在显示第一层图像,后面21.78×21.78μm代表图像长宽的真实大小,400×400代表pixel的数量,8-bit代表图像位深;那么现在我希望两个单通道和merge图像同时显示在一张图中,该如何操作呢?

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

首先将图像拆分成单通道图像(Image-Color-SplitChannels…拆分通道),保存;再同时保存一个merge(Image-Color-Merge Channels…进行通道merge)之后的文件,然后同时在软件中打开这三个文件,调整好亮度和对比度,如下:

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

将图像类型逐个改成RGB color

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

改完了之后,点击Image-Stacks-Tools-Combine,

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

出现以下这个界面,在Stacks1和2中选择两个单通道文件,勾选Combine vertically则是竖向排列,否则是横向排列,这里不勾,

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

然后就会生成下面的文件

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

重复上述操作,处理剩余图像和上面生成的图像,就会得到如下文件,看吧,这样就可以同时显示啦,是不是很酷呀?

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

删除Stack文件中的某一张

第二个常用的功能就是删除stack文件中的某一张,操作如下:首先在软件中打开一个stack文件,然后调节下方红框内的滑块到希望删掉的那张图

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

然后选择Image-Stacks-Delete slice,即可直接删除(慎重操作!),删除之后,上面那张图的亮度会淡一些,毕竟是删掉了一个图层。

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

Concatenate功能

接下来我们来说下Concatenate,把多个图像合成一个stack或hyperstack文件。可以做时间合并,假如说在拍时间序列图的时候,中间停了一下仪器,可能加了个药,或者可能最开始设定的时间到了,后面还想再接着拍,这样的话,我们就必须得把这几个片段合成一个完整的时间序列图展示,这时可以用这个功能啦,因为步骤和上面的类似,这里就不展示具体操作了,感兴趣的小伴可以自己试试哦!

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

其他功能

另外在下图红框内的功能其实也比较简单,这里不一一说明了,大家回去自己操作一下就知道干啥的啦。

如何拆分图片变成两个单通道和merge图像同时展示?

 

好啦,今天的分享就到这里啦,大家如果有感兴趣的功能想要了解,可以在下方留言哦!

鉴于有些同学说Fiji很难下载,下面我把Fiji的win64版和mac版放在了网盘里面,有需要的请自行下载。

下载地址

百度网盘:链接:https://pan.baidu.com/s/123iJBm5JRUbJ8hJ8wPuGtA 提取码:s950

这些可能会帮助到你: 问答社区 | 共享百度SVIP | 留言建议

欢迎入群交流:生信分析群: 732179952 · Meta分析群: 797345521 · 医学科研交流群: 797345521

发表评论

电子邮件地址不会被公开。 必填项已用*标注