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网络药理学网站总结

网络药理学是基于系统生物学理论而产生的一门新学科。

近年来,特别流行通过网络药理学进行药物的靶点预测,进一步实验验证,一定程度上简化了“盲人摸象式”的前期研究,也增强了最终确定的靶点可信度。即所谓的“干实验+湿实验”。

网络药理学网站总结

网络药理学的研究过程需要接触大量的数据库和专业网站,这是保证靶点预测准确度的前提,也是网络药理学的基本功。

网络药理学网站总结

因此,如果你想要做网络药理学相关的研究或分析,那么以下网站你必须得熟练查阅。

这里有一个汇总,供参考。


 

网站名字
网站地址
TTD https://db.idrblab.org/ttd/
Drugbank https://www.drugbank.ca/
DisGeNET http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/menu/home
OMIM  http://www.omim.org/
KEGG http://www.kegg.jp/
PharmGkb https://www.pharmgkb.org/
GAD https://geneticassociationdb.nih.gov/
HAGR http://genomics.senescence.info/ 
T-HOD http://bws.iis.sinica.edu.tw/THOD
CardioGenBase http://www.CardioGenBase.com/
arrhythmia database http://www.fsm.it/cardmoc/
OncoDB.HCC  http://oncodb.hcc.ibms.sinica.edu.tw/index.htm 
Liverome  http://liverome.kobic.re.kr/index.php 
Uniprot http://www.uniprot.org/ 
DAVID https://david.ncifcrf.gov/
STRING https://string-db.org/ 
BioGRID https://thebiogrid.org/
IntAct https://www.ebi.ac.uk/intact/ 
HPRD http://www.hprd.org/ 
GENEMANIA http://genemania.org/ 
TCMSP http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php  
TCMID http://www.megabionet.org/tcmid/ 
TCM Database@Taiwan http://tcm.cmu.edu.tw/
TCMGeneDIT http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/
BATMAN-TCM http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/
TCM-PTD http://tcm.zju.edu.cn/ptd/
TCM-MESH http://mesh.tcm.microbioinformatics.org/ 
PubChem https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
HIT http://lifecenter.sgst.cn/hit/
Binding DB http://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
ChemBank http://chembank.broadinstitute.org/
ChemMapper http://lilab.ecust.edu.cn/chemmapper/
ALOGPS2.1 http://www.vcclab.org/lab/alogps/
SwissTargetPrediction  http://www.swisstargetprediction.ch/
PharmMapper http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/index.php 
SEA http://sea.bkslab.org/
STITCH              http://stitch.embl.de/
PASS http://www.pharmaexpert.ru/PASSOnline/
SuperPred http://prediction.charite.de/ 
DRAR-CPI http://cpi.bio-x.cn/drar/?page=home
Cytoscape  http://www.cytoscape.org/
COXPRESdb http://coxpresdb.jp/ 
MetaboAnalyst  http://www.metaboanalyst.ca/ 
DAVID https://david.ncifcrf.gov/ 
Metascape  http://metascape.org/ 
GEO https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
CMAP https://portals.broadinstitute.org/cmap/ 
affymetrix https://www.affymetrix.com/analysis/netaffx/batch_query.affx?netaffx=netaffx4_annot
Venny2.1 http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html 
Venn diagram http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ 
E Chart http://www.ehbio.com/ImageGP/ 

注:以上网站大多属于国外运营,有时会打不开,并不是网址有误。这种情况也是做网络药理学分析时最不愿意看到的。所以有点子了,就赶紧检索并即时备注检索时间和存储数据,别无他法。
来源: http://www.sci666.com.cn/33206.html

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