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非编码RNA数据库使用与ceRNA网络构建实操(免费下载)小张聊科研

非编码RNA数据库使用与ceRNA网络构建实操(免费下载)小张聊科研

简  介 本课程着重讲解如何利用公共数据库来构建ceRNA网络。 本课程讲解了ceRNA的基本概念,以及如何利用公共数据库和一些本地版软件来预测miRNA的靶基因。从而通过合并miRNA-mRNA以及lncRNA或circRNA之间的调控关系来构建ceRNA网络。 课程中也会跟大家分享一些构建ceRNA网络的思路和研究方法。
1. 机构的品牌信息   
小张聊科研微信公众号自筹课程
本课程为录播课,实际内容共计35节。2. 主讲教师
李老师,生物信息学博士,有八年的测序数据分析经验。博士期间参与多个课题项目,涉及机器学习,芯片数据分析,核酸及蛋白序列分析,全基因组甲基化测序数据分析,全转录组测序数据分析,miRNA及靶基因分析,癌症相关基因预测及预后分析等,发表SCI论文32篇,其中一作及并列一作15篇。3. 课程的特色   
本课为实操课,注重实用性,课程展示非编码数据库使用的操作步骤,介绍如何利用这些数据库寻找靶基因,并整合到一起,最终构建ceRNA网络,学员可根据操作方法学会自己找靶点和构建ceRNA网络。

4.课程目录

01-ceRNA理论 19-starbase-2
02-miRNA概述 20-starbase-3
03-circRNA概述 21-gencode
04-lncRNA概述 22-调控lncRNA的miRNA预测
05-miRBase 23-spongescan
06-targetscan 24-circBase
07-targetscan文件介绍 25-调控circRNA的miRNA预测
08-targetscan实操 26-circMIR软件
09-miRNA靶基因功能富集 27-CSCD
10-targetscan本地版本介绍 28-circinteractome
11-targetscan本地版本实操 29-lncRNA相关ceRNA网络思路解读(一)
12-miRanda下载安装 30-lncRNA相关ceRNA网络思路解读(二)
13-miRanda实操 31-circRNA相关ceRNA网络思路解读(一)
14-RNAhybrid软件介绍 32-circRNA相关ceRNA网络思路解读 (二)
15-RNAhybrid软件实操 33-lncRNA相关ceRNA网络实操-1
16-miRTarbase 34-lncRNA相关ceRNA网络实操-2
17-miRcode 35-circRNA相关ceRNA网络实操
18-starbase-1

 

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评论列表(24条)

  • 827156508
    827156508 2020年4月1日 下午8:48

    老师您好,可以分享一下小张聊科研的lncRNA数据库,ceRNA相关的网课吗?xuebojun51@163.com~想了解相关知识谢谢!!

  • Silence Of Leo
    Silence Of Leo 2020年3月30日 下午5:21

    你好,可以分享小张聊科研相关网课,lncRNA挖掘、ceRNA相关的,自用。ahwgpxjc@163.com,谢谢

  • 啥也不會 👀💤
    啥也不會 👀💤 2020年3月25日 下午5:45

    老师您好,可以分享一下小张聊科研的lncRNA数据库,ceRNA相关的网课吗?405035508@qq.com~想系统学习相关知识谢谢!!

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