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TCGA数据库肿瘤突变负荷视频(生信自学网)免费下载

TCGA数据库肿瘤突变负荷视频(TMB/tumor mutation burden/免疫细胞)

 

 

课程分四部分的内容:

第一部分

TMB就是肿瘤组织每兆碱基中突变的总数。通俗的讲,就是肿瘤基因的突变密度,也就是肿瘤基因组中平均有多少突变,包括基因编码错误、碱基替换、基因插入和确实错误的总数。

一定程度上可以理解成单位区域内发生变换的密度总量越大,肿瘤突变负荷(TMB)越高,那么可能相应的肿瘤相关的致癌突变越多,每个肿瘤的个性就越突出,越不同于正常细胞。

肿瘤免疫治疗的精髓就是通过各种方法换气、加强机体的免疫系统对肿瘤的杀伤。这种情况下,肿瘤突变负荷(TMB)越大,即突变越大的癌细胞,越不像正常细胞,越容易被免疫细胞发现,越容易成为肿瘤免疫的靶子,从而理论上讲越有可能对免疫治疗有效。

TMB越高的肿瘤病人对于免疫反应的效果越好。

突变数据下载

突变数据常见图形

计算肿瘤突变负荷

第二部分:

TMB和生存关系

TMB和临床性状关系

第三部分:TMB和基因表达的关系

第四部分:突变和免疫浸润关系

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