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通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

文献检索是科研的基本功。传统检索文献的方法大多以关键词、主题词、作者、期刊名称等为线索,查找符合要求的文章。然而,这种检索方法忽略了科技论文的精髓插图。在查阅文献时,直接阅读插图与图注是快速了解文章内容的捷径。所以,如果能直接通过关键词搜索插图,将会极大地提高查找文献的效率和精准度。今天,我以生物医学研究的明星信号通路NF-κB为例,介绍一种直观查询文献的新方法以图搜文法。

 

1. Openi检索,网址:https://openi.nlm.nih.gov/(首推)

Openi是美国国立卫生研究院开发的科研图片数据库,其搜索出来的结果全部与生物医学相关。我们输入关键词NF-κB,点击搜索。可以看到与NF-κB相关的免疫组化、免疫印迹、荧光染色和信号通路图等。

 

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

 

 鼠标悬停于感兴趣的图片上方,会显示图片来源文章的标题、作者、期刊名称、Figure legend等。点击图片,可以查到图片来源文献的摘要、实验方法描述、主题词和全文链接。

 

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

通过组合不同的关键词,可以更精确的找到想要的插图。如搜索“NF-κB pathway”,可以精确地找到NF-κB信号通路图,为作图提供素材。搜索“NF-κB western blotting”“NF-κB immunofluorescence”,可以精确找到相关的免疫印迹和免疫荧光图。如果你想查询如何用WB检测NF-κB激活,搜索“NF-κB activation westernblotting”,就可以快速找到关键信息。

 

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

 

如下图所示,通过搜索“NF-κB activation westernblotting”,可以看到检测IKKβIκBα磷酸化、IκBα降解和p65的细胞核移位可用于评价NF-κB的激活情况;同时可知细胞核蛋白可以用LaminB作为内参,而不能用β-actin作内参。用这种方式查找实验方法,比通过关键词的方法找,简直不要快太多!

 

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此外,我们还可以通过设置Limitis,限制来源文献的类型、图片格式和研究领域等。如将Article Type限制为Review Article,搜索出来的全是高大上的综述配图,组会PPT汇报吊打同门妥妥的!

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更为强大的是,Openi还可以图搜图,根据你提供的感兴趣的图片,自动联想搜索所有类似的图片,这样就不需要苦苦思索用哪个关键词来检索了。

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关于Openi的介绍和详细检索方法,可以查询以下网址:https://lhncbc.nlm.nih.gov/system/files/pub2012019.pdf

https://lhncbc.nlm.nih.gov/system/files/tr2010002.pdf

http://info.hsls.pitt.edu/updatereport/?p=11998

 

2. PMC Images,网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

PMC Images 也是美国国立卫生研究院旗下的图片数据库。以前的PMC Images没有独立的查询网站,其搜索结果伴随着Pubmed的检索而出现。现在可以通过登录https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/直接进入PMC Images搜索页面。如下图,键入NF-κB点击搜索,页面右下角有PMC Images search for NF-κB

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

 

点击see more,可以看到有4258张与NF-κB相关的插图。每张图都列出了详细的标题、图注以及来源文献。类似的,也可以通过组合不同的关键词获得感兴趣的插图。

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3. VizioMetrics,网址:http://viziometrics.org/

 Viziometrics是由美国华盛顿大学开发的一款学术图片搜索引擎,收录了来自PubMed的生物医学插图。Viziometrics的搜索结果包含5种插图类型:图片、照片、技术流程、表格和公式等。Openi网站类似,输入NF-κB,可以找到很多相关的插图。直接点击图片就可看到相对应的文章标题、作者、杂志名称和数据内容。

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

 

OpeniPMC images相比,VizioMetrics的一个优点就是可选择Impact模式,让搜索结果根据来源文章的影响力(引用次数)排序。如下图,运用Impact模式搜索NF-κB,获得的插图大概率是来自于CNS系列等高影响力的杂志。

 

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4. 中国知网学术图片库,网址:http://image.cnki.net/

科研图片搜索怎么少得了知网这个什么东西呢?知网学术图片库中的图片出自CNKI收录的文献,现有超过3200万张,涵盖了所有学科和文献类型,包括学位论文、会议论文、报纸全文和专利全文等。类似的,中国知网学术图片库也可以通过关键词(图片搜索)和以图搜图(相似搜索)的方式进行检索。

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

 

与上述的数据库类似,输入NF-κB,可以获得许多相关的插图。这些插图来源于中文文献,但是像素较低。与上述的数据库相比,知网图库在分类方面做得很细致,可通过限定图片颜色、学科、发表年度、关键词和图片类别等满足各种需求。

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如下图,通过搜索“Hela细胞,然后限定关键词为细胞图,可查看Hela细胞的正常形态。此外,通过限定关键词,还可以查询相关的质粒图谱、电泳条带、基因序列图、荧光光谱图等,各种素材应有尽有。

通过插图精准搜索相关的文献——以图检索文献

怎么样,以图搜文的检索方法很赞吧!俗话说, “A picture is worth a thousand words”。通过搜索插图不仅可以快速掌握文章的信息,还能精准地找到实验的关键信息,赶紧学起来吧!

来源: http://www.sci666.com.cn/11135.html

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